70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2399 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2399  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3149  hypothetical protein  38.92 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.717167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3961  hypothetical protein  40.46 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0143  hypothetical protein  28.75 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.184746  normal  0.13553 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1530  hypothetical protein  25.68 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1714  hypothetical protein  29.44 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0193  hypothetical protein  30.06 
 
 		 380 aa  82.8  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0128  OpgC protein  30.73 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.253754  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1765  OpgC protein  30 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.411843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1952  acyltransferase family protein  30.05 
 
 		 403 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838522 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1763  hypothetical protein  27.27 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1967  hypothetical protein  26.11 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1356  acyltransferase family protein  28.35 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3041  OpgC protein  25.23 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0765  hypothetical protein  25.13 
 
 		 421 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191126  hitchhiker  0.00877498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5254  hypothetical protein  24.53 
 
 		 421 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15377  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4912  putative OpgC protein  24.14 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1295  OpgC protein-like protein  27.08 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4163  putative OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  25.71 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4266  OpgC protein, require for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  26.87 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3279  hypothetical protein  26.69 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2146  putative OpgC protein  27.4 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1533  hypothetical protein  26.46 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.208932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3844  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  29.35 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2806  hypothetical protein  26.83 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1649  putative opgC protein  28.5 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0845152  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3644  hypothetical protein  27.68 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.82541  normal  0.662915 
 
 
-
 
NC_004310  BR1706  opgC protein, putative  28.5 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0899  putative OpgC protein  22.46 
 
 		 484 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4886  hypothetical protein  25.75 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00335271  normal  0.121358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0136  acyltransferase 3  23.25 
 
 		 415 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2302  putative OpgC protein  27.12 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7260  putative opgC protein  28 
 
 		 365 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3201  hypothetical protein  24.93 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4172  putative protein required for succinylation of osmoregulated periplasmic glucans  25 
 
 		 412 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3154  hypothetical protein  26.76 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0788  putative OpgC protein  23.51 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.107967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4043  hypothetical protein  23.96 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0814624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2190  OpgC protein  27.96 
 
 		 380 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.013941  normal  0.776218 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5546  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.753322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5314  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0258075  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4947  hypothetical protein  29.78 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0337117  normal  0.0617497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4726  hypothetical protein  25.7 
 
 		 374 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0112  hypothetical protein  24.77 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0354  hypothetical protein  29.09 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0222  acyltransferase 3  24.33 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2532  putative OpgC protein  24.62 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5561  OpgC protein  25.13 
 
 		 366 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2280  hypothetical protein  28.97 
 
 		 377 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0956808  normal  0.124268 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4870  hypothetical protein  24.38 
 
 		 374 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0389  hypothetical protein  29.28 
 
 		 375 aa  46.2  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal  0.347328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0127  hypothetical protein  29.8 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2936  putative OpgC protein  28.92 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.376273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2784  putative OpgC protein  22.67 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.537319  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1209  OpgC protein  40 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1455  opgC protein, putative  24.58 
 
 		 431 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0928141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5417  hypothetical protein  24.73 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1700  hypothetical protein  35 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646049  normal  0.417956 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2232  putative OpgC protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2919  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3043  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1258  putative OpgC protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1953.1  putative OpgC protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.584831  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0971  putative OpgC protein  33.33 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.346061  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2545  hypothetical protein  26.92 
 
 		 435 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3260  hypothetical protein  25.23 
 
 		 374 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.117077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1292  hypothetical protein  26.92 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.721531  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2228  OpgC protein  24.38 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.297426 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1372  hypothetical protein  26.92 
 
 		 388 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>