More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0041 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
330 aa  651    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.5364  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26780  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  61.42 
 
 
327 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.498832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.56 
 
 
333 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal  0.208891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  52.8 
 
 
326 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4448  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  49.06 
 
 
324 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00527977  normal  0.14631 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6231  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.78 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.512289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5134  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.66 
 
 
344 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10070  putative zinc-dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
328 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475376  normal  0.909575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0930  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.16 
 
 
328 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0155  zinc-binding dehydrogenase  37.42 
 
 
327 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1971  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.16 
 
 
328 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1453  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.5 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0174615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18380  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  35.56 
 
 
327 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
329 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1952  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.54 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.56 
 
 
331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.34 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 
333 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  31.3 
 
 
334 aa  119  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.27 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  29.88 
 
 
328 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.24 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04350  quinone reductase  31.93 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.7 
 
 
332 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.44 
 
 
326 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.93 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.59 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.79 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3188  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.05 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.770157  normal  0.0417244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.92 
 
 
324 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.27 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4274  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
326 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.822428  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  30.49 
 
 
320 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5387  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
329 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0289  putative NADPH-quinone oxidoreductase, Zn containing  30.27 
 
 
349 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  35.65 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.86 
 
 
328 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5639  alcohol dehydrogenase  31.45 
 
 
329 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.49 
 
 
338 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
327 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.5 
 
 
321 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000022092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.96 
 
 
323 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.82 
 
 
338 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3874  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.163393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0488  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
318 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4717  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.239954  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3646  alcohol dehydrogenase  34.73 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  29.29 
 
 
328 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
332 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.07 
 
 
326 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.46 
 
 
327 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.74 
 
 
342 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5025  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
345 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5835  alcohol dehydrogenase  30.18 
 
 
345 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.91 
 
 
322 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0533  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.91 
 
 
333 aa  106  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0360473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2299  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.63 
 
 
329 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.830283  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
329 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.41 
 
 
342 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  29.05 
 
 
324 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.59 
 
 
322 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
325 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4344  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  29.79 
 
 
356 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3490  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.89 
 
 
315 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.87 
 
 
331 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  33.13 
 
 
329 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  30.15 
 
 
318 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49690  oxidoreductase  30.42 
 
 
328 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 
322 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3872  alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
324 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0387  quinone oxidoreductase  31.72 
 
 
329 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665371  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3137  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.18 
 
 
310 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2144  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.24 
 
 
318 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  28.4 
 
 
389 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.74 
 
 
333 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2092  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.64 
 
 
318 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.077792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.38 
 
 
328 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.57 
 
 
327 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.43 
 
 
328 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
324 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1738  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
326 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01200  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
358 aa  101  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4323  putative oxidoreductase, zinc-containing alcohol dehydrogenase  34.72 
 
 
333 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3044  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.85 
 
 
369 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.821698 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1679  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  30.36 
 
 
334 aa  100  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.74 
 
 
334 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3672  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
337 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5850  alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 
328 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7910  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.93 
 
 
302 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.989573  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3210  alcohol dehydrogenase  31.74 
 
 
330 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.805863 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07194  quinone oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02090)  28.32 
 
 
336 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.362301  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  28.27 
 
 
328 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1835  alcohol dehydrogenase  30.49 
 
 
329 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.573189  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.82 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2167  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.76 
 
 
327 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  27.68 
 
 
328 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>