47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0100 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0100  anibiotic ABC transporter efflux pump  100 
 
 		 526 aa  1004    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.995514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0998  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  36.67 
 
 		 529 aa  276  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11241  tetronasin ABC transporter membrane protein  36.97 
 
 		 548 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.157324  normal  0.0850249 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25810  putative exporter of polyketide antibiotics  36.63 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5633  ABC transporter membrane-spanning protein  34.44 
 
 		 566 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00963141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5389  hypothetical protein  37.02 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.539443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5389  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  38.7 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.195066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36960  putative exporter of polyketide antibiotics  32.96 
 
 		 561 aa  219  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0634645 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0324  hypothetical protein  30 
 
 		 534 aa  217  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.235362 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4602  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.54 
 
 		 652 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0321  putative ABC-2 type transport system permease protein  37.43 
 
 		 545 aa  210  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2212  putative ABC antibiotics transporter  35.94 
 
 		 528 aa  206  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3675  anibiotic ABC transporter efflux pump  38.16 
 
 		 532 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0536  anibiotic ABC transporter efflux pump  33.27 
 
 		 531 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2539  hypothetical protein  34.64 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2781  hypothetical protein  35.17 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.998834  decreased coverage  0.000210195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3202  hypothetical protein  35.26 
 
 		 550 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2718  hypothetical protein  34.39 
 
 		 539 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0146  hypothetical protein  33.88 
 
 		 565 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2584  hypothetical protein  33.89 
 
 		 552 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.455058 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0013  hypothetical protein  30.45 
 
 		 555 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.837368 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16520  putative exporter of polyketide antibiotics  32.81 
 
 		 555 aa  179  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2560  putative ABC transporter  33.89 
 
 		 523 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5315  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  33.4 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.52035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0250  putative exporter of polyketide antibiotics  29.78 
 
 		 530 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3550  anibiotic ABC transporter efflux pump  34.22 
 
 		 549 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.195384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3754  putative ABC transporter permease protein  32.72 
 
 		 551 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.572399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1756  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  34.05 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0241834  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3998  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.57 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0900776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4072  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.57 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0567085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4012  putative ABC transporter membrane-spanning protein  33.57 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1666  putative ABC antibiotics transporter  29.98 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0957326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1835  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.94 
 
 		 534 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2196  putative ABC transporter membrane-spanning protein  31.17 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4500  putative ABC transporter membrane-spanning protein  32.67 
 
 		 540 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.949978  normal  0.795337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2194  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  32.36 
 
 		 542 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0742009  normal  0.0623246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2619  Putative exporter of polyketide antibiotics- like protein  32.08 
 
 		 527 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000786426  normal  0.0934856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2251  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.98 
 
 		 542 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2205  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  31.98 
 
 		 542 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1052  putative exporter of polyketide antibiotics  23.06 
 
 		 500 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06700  putative exporter of polyketide antibiotics  31.12 
 
 		 496 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3297  putative ABC transporter  28.86 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1177  putative exporter of polyketide antibiotics  24.32 
 
 		 536 aa  118  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.9044  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1680  putative ABC antibiotics transporter  31.95 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.506245 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2921  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  30.32 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.595685  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22140  putative exporter of polyketide antibiotics  31.1 
 
 		 527 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.357083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5398  putative exporter of polyketide antibiotics-like protein  33.51 
 
 		 270 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>