14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0084 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0084  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  266  7e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4613  hypothetical protein  53.28 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.787704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4824  hypothetical protein  48 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1909  hypothetical protein  51.24 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409563  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2616  hypothetical protein  48.36 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2577  hypothetical protein  49.18 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2622  hypothetical protein  49.18 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0727892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0697  hypothetical protein  34.74 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.756425 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5920  hypothetical protein  29.91 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2804  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3471  hypothetical protein  26.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109556  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0396  hypothetical protein  27.78 
 
 		 115 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0199  hypothetical protein  28.7 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>