2861 genes were found for organism Vibrio cholerae O395



Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
VC0395_A0001  CDS  NC_009457  3023753  811  -  1128  membrane-bound lytic murein transglycosylase C  YP_001215975  hitchhiker  0.00000000000403894  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0002  CDS  NC_009457  913  1185  -  273  hypothetical protein  YP_001215976  hitchhiker  0.000000338126  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0003  CDS  NC_009457  1199  2260  -  1062  A/G-specific adenine glycosylase  YP_001215977  hitchhiker  0.000019513  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0004  CDS  NC_009457  2281  2442  -  162  hypothetical protein  YP_001215978  hitchhiker  0.00127215  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0005  CDS  NC_009457  2500  3219  +  720  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  YP_001215979  normal  0.0101638  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0006  CDS  NC_009457  3426  4376  +  951  glutaminase  YP_001215980  normal  0.110164  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0007  CDS  NC_009457  4597  5772  -  1176  coproporphyrinogen III oxidase  YP_001215981  normal  0.712639  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0008  CDS  NC_009457  5766  6368  -  603  putative deoxyribonucleotide triphosphate pyrophosphatase  YP_001215982  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0009  CDS  NC_009457  6438  6869  -  432  hypothetical protein  YP_001215983  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0010  CDS  NC_009457  6915  7205  -  291  hypothetical protein  YP_001215984  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0011  CDS  NC_009457  7205  7762  -  558  hypothetical protein  YP_001215985  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0012  CDS  NC_009457  7816  8634  -  819  pyrroline-5-carboxylate reductase  YP_001215986  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0013  CDS  NC_009457  8687  9397  -  711  hypothetical protein  YP_001215987  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0014  CDS  NC_009457  9423  10460  +  1038  twitching motility protein PilT  YP_001215988  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0015  CDS  NC_009457  10475  11581  +  1107  twitching motility protein PilU  YP_001215989  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0016  CDS  NC_009457  11693  12496  +  804  LuxR family transcriptional regulator  YP_001215990  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0017  CDS  NC_009457  12581  13885  +  1305  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_001215991  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0018  CDS  NC_009457  13923  14345  -  423  Holliday junction resolvase-like protein  YP_001215992  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0019  CDS  NC_009457  14426  15028  -  603  hypothetical protein  YP_001215993  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0020  CDS  NC_009457  15025  15981  -  957  glutathione synthetase  YP_001215994  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0021  CDS  NC_009457  15995  16726  -  732  16S ribosomal RNA methyltransferase RsmE  YP_001215995  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0022  CDS  NC_009457  16865  17560  -  696  extracellular deoxyribonuclease  YP_001215996  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0023  CDS  NC_009457  17690  18178  -  489  hypothetical protein  YP_001215997  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0024  CDS  NC_009457  18289  19446  -  1158  S-adenosylmethionine synthetase  YP_001215998  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0025  CDS  NC_009457  19619  19774  -  156  hypothetical protein  YP_001215999  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0026  CDS  NC_009457  19724  21808  +  2085  transketolase  YP_001216000  normal  0.0910343  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0027  CDS  NC_009457  21880  22776  -  897  iron-regulated virulence regulatory protein IrgB  YP_001216001  normal  0.0122386  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0028  CDS  NC_009457  22921  24879  +  1959  enterobactin receptor protein  YP_001216002  decreased coverage  0.0000507235  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0029  CDS  NC_009457  25031  26056  +  1026  erythrose 4-phosphate dehydrogenase  YP_001216003  decreased coverage  0.000119037  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0030  CDS  NC_009457  26190  27368  +  1179  phosphoglycerate kinase  YP_001216004  normal  0.0377211  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0031  CDS  NC_009457  27524  28600  +  1077  fructose-bisphosphate aldolase  YP_001216005  normal  0.218683  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0032  CDS  NC_009457  28896  29759  +  864  hypothetical protein  YP_001216006  normal  0.20954  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0033  CDS  NC_009457  29823  30458  -  636  LysE family protein  YP_001216007  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0034  CDS  NC_009457  30623  31519  +  897  chromosome replication initiation inhibitor protein  YP_001216008  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0035  CDS  NC_009457  31599  32315  +  717  hypothetical protein  YP_001216009  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0036  CDS  NC_009457  32648  32779  +  132  hypothetical protein  YP_001216010  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0037  CDS  NC_009457  32851  34263  -  1413  pyruvate kinase  YP_001216011  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0038  CDS  NC_009457  34679  35461  +  783  DeoR family transcriptional regulator  YP_001216012  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0039  CDS  NC_009457  35524  37356  +  1833  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  YP_001216013  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0040  CDS  NC_009457  37417  38496  -  1080  putative extracellular solute-binding protein  YP_001216014  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0041  CDS  NC_009457  38638  38784  -  147  hypothetical protein  YP_001216015  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0042  CDS  NC_009457  38753  40513  -  1761  hypothetical protein  YP_001216016  normal  0.715223  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0043  tRNA  NC_009457  40982  41057  -  76  tRNA-Met    normal  0.0603767  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0044  CDS  NC_009457  41202  43067  -  1866  RNA polymerase sigma factor RpoD  YP_001216017  hitchhiker  0.00416651  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0045  CDS  NC_009457  43166  44995  -  1830  DNA primase  YP_001216018  hitchhiker  0.00000233993  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0046  CDS  NC_009457  45019  45462  -  444  hypothetical protein  YP_001216019  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0047  CDS  NC_009457  45492  45707  -  216  30S ribosomal protein S21  YP_001216020  hitchhiker  0.00000000000427193  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0048  CDS  NC_009457  45735  45905  -  171  hypothetical protein  YP_001216021  unclonable  4.65006e-16  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0049  CDS  NC_009457  45948  46967  +  1020  putative DNA-binding/iron metalloprotein/AP endonuclease  YP_001216022  unclonable  0.0000000000000462165  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0050  CDS  NC_009457  47121  47933  +  813  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  YP_001216023  hitchhiker  0.0000263931  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0051  CDS  NC_009457  47982  48608  -  627  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  YP_001216024  hitchhiker  0.00859928  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0052  CDS  NC_009457  48761  49150  +  390  putative dihydroneopterin aldolase FolB  YP_001216025  normal  0.148451  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0053  CDS  NC_009457  49147  49653  +  507  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  YP_001216026  normal  0.354384  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0054  CDS  NC_009457  49650  50453  +  804  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  YP_001216027  normal  0.849769  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0055  CDS  NC_009457  50562  50852  +  291  cell division protein FtsB  YP_001216028  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0056  CDS  NC_009457  50849  51547  +  699  2-C-methyl-D-erythritol 4-phosphate cytidylyltransferase  YP_001216029  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0057  CDS  NC_009457  51544  52020  +  477  2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase  YP_001216030  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0058  CDS  NC_009457  52050  53135  +  1086  tRNA pseudouridine synthase D  YP_001216031  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0059  CDS  NC_009457  53098  53889  +  792  stationary phase survival protein SurE  YP_001216032  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0060  CDS  NC_009457  53882  54508  +  627  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  YP_001216033  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0061  CDS  NC_009457  54508  55443  +  936  lipoprotein NlpD  YP_001216034  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0062  CDS  NC_009457  55517  56524  +  1008  RNA polymerase sigma factor RpoS  YP_001216035  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0063  CDS  NC_009457  56617  59205  -  2589  DNA mismatch repair protein MutS  YP_001216036  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0064  CDS  NC_009457  59473  60360  -  888  cysteine synthase B  YP_001216037  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0065  CDS  NC_009457  60744  61745  +  1002  thiosulfate ABC transporter, periplasmic thiosulfate-binding protein  YP_001216038  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0066  CDS  NC_009457  61822  62673  +  852  sulfate ABC transporter, permease protein  YP_001216039  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0067  CDS  NC_009457  62685  63548  +  864  sulfate ABC transporter, permease protein  YP_001216040  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0068  CDS  NC_009457  63545  64675  +  1131  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  YP_001216041  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0069  CDS  NC_009457  64842  65348  +  507  CinA family protein  YP_001216042  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0070  CDS  NC_009457  65482  66546  +  1065  recombinase A  YP_001216043  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0071  CDS  NC_009457  66679  67137  +  459  recombination regulator RecX  YP_001216044  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0072  CDS  NC_009457  67310  69892  +  2583  alanyl-tRNA synthetase  YP_001216045  normal  0.163524  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0073  CDS  NC_009457  69924  70058  +  135  hypothetical protein  YP_001216046  hitchhiker  0.000193299  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0074  CDS  NC_009457  70096  71283  +  1188  aspartate kinase  YP_001216047  hitchhiker  0.000000000101932  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0075  CDS  NC_009457  71375  71572  +  198  carbon storage regulator  YP_001216048  decreased coverage  0.000000000000905817  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0076  tRNA  NC_009457  71754  71846  +  93  tRNA-Ser    decreased coverage  0.000000000000654825  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0077  tRNA  NC_009457  71880  71956  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.00000000000716248  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0078  tRNA  NC_009457  71979  72071  +  93  tRNA-Ser    hitchhiker  0.0000000000727042  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0079  tRNA  NC_009457  72138  72214  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.000000061602  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0080  tRNA  NC_009457  72270  72346  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.000000233743  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0081  tRNA  NC_009457  72419  72495  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.000000923685  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0082  tRNA  NC_009457  72551  72627  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.00000302683  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0083  tRNA  NC_009457  72699  72775  +  77  tRNA-Arg    hitchhiker  0.000000215013  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0084  CDS  NC_009457  73142  73402  +  261  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  YP_001216049  hitchhiker  0.000518126  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0085  CDS  NC_009457  73431  75224  +  1794  oxaloacetate decarboxylase  YP_001216050  normal  0.0260292  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0086  CDS  NC_009457  75234  76364  +  1131  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  YP_001216051  normal  0.923092  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0087  CDS  NC_009457  76424  77437  +  1014  quinone oxidoreductase  YP_001216052  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0088  CDS  NC_009457  77431  77892  +  462  hypothetical protein  YP_001216053  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0089  CDS  NC_009457  77899  80757  +  2859  insulinase family protease/insulinase family protease  YP_001216054  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0090  CDS  NC_009457  80869  82443  +  1575  glutamate--cysteine ligase  YP_001216055  normal  1  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0091  CDS  NC_009457  82492  83010  +  519  S-ribosylhomocysteinase  YP_001216056  normal  0.390825  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0092  CDS  NC_009457  83080  84360  -  1281  hypothetical protein  YP_001216057  normal  0.0306325  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0093  CDS  NC_009457  84443  85246  -  804  hypothetical protein  YP_001216058  hitchhiker  0.00000700922  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0094  CDS  NC_009457  85450  86835  +  1386  signal recognition particle protein  YP_001216059  hitchhiker  0.000000000000225089  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0095  CDS  NC_009457  87071  87319  +  249  30S ribosomal protein S16  YP_001216060  hitchhiker  0.000000000315992  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0096  CDS  NC_009457  87347  87901  +  555  16S rRNA-processing protein RimM  YP_001216061  hitchhiker  0.00000000752452  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0097  CDS  NC_009457  87929  88672  +  744  tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  YP_001216062  hitchhiker  0.00000000311515  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0098  CDS  NC_009457  88714  89067  +  354  50S ribosomal protein L19  YP_001216063  hitchhiker  0.0000000154416  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0099  CDS  NC_009457  89188  90246  -  1059  protease DegS  YP_001216064  hitchhiker  0.00000000230294  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
VC0395_A0100  CDS  NC_009457  90423  91793  -  1371  protease DO  YP_001216065  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a    Vibrio cholerae O395  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 29    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>