37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0084 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0084  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000518126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  64.71 
 
 		 85 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  63.53 
 
 		 92 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0638  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  58.33 
 
 		 83 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.471241  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  43.9 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  36.14 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2987  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  38.16 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.809625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3069  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  36.49 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3166  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  38.16 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1048  oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  33.72 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.299241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2894  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  41.03 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11111  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1198  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  37.5 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0495339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2481  oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  36.59 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.54 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.54 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  40.54 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  33.77 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1029  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  35.37 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  40.74 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  37.5 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1125  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  36.47 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.65585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  40.54 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1091  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  36.47 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3267  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  34.12 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0150987 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3377  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  45.24 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0177539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1219  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  34.15 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000225864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1024  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  38.46 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02842  putative oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.03 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00149059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1065  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  37.35 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1320  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  32.93 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219843  hitchhiker  0.0088654 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3013  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  42.65 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0628711  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3337  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  31.71 
 
 		 81 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  33.33 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.46 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  36.14 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>