25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0321 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  41.38 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  41.67 
 
 		 83 aa  67  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0970  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  37.21 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2894  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  37.93 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11111  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  34.78 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.82 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.82 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.82 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.53 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  33.75 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2481  oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  34.09 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  39.53 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  32.5 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  38.37 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3195  sodium pump decarboxylases, gamma subunit  35.23 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.139992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  37.78 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  32.93 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0638  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  34.88 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.471241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3337  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  32.53 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0063  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  36.47 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A3616  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  37.21 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.384488  normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  50 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_1320  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  30.39 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219843  hitchhiker  0.0088654 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0060  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  50 
 
 		 79 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  1 
 
 
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