38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0009 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0009  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002452  hypothetical protein  69.93 
 
 
143 aa  197  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03582  hypothetical protein  68.53 
 
 
143 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0539  hypothetical protein  65.55 
 
 
143 aa  173  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.703361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1133  hypothetical protein  41.96 
 
 
144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664449  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3357  hypothetical protein  42.66 
 
 
144 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3029  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00182183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1334  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000385452  hitchhiker  0.0000682946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3044  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000942891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2691  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.572977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3187  hypothetical protein  43.75 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000444693  normal  0.170187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1189  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177556  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1190  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201657  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1260  hypothetical protein  43.06 
 
 
144 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719621  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03301  hypothetical protein  45.39 
 
 
173 aa  123  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3666  hypothetical protein  44.68 
 
 
146 aa  123  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2481  hypothetical protein  44.06 
 
 
144 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.330818  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1123  hypothetical protein  42.34 
 
 
144 aa  120  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000274951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1328  hypothetical protein  44.44 
 
 
144 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1228  hypothetical protein  40.97 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000394867  normal  0.28109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3721  hypothetical protein  45.24 
 
 
134 aa  114  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2685  hypothetical protein  36.88 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05060  hypothetical protein  39.16 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2864  hypothetical protein  38.89 
 
 
153 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0248676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0487  hypothetical protein  38.46 
 
 
139 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4157  hypothetical protein  40.65 
 
 
138 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4972  hypothetical protein  38.36 
 
 
144 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5099  hypothetical protein  39.04 
 
 
144 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.403368  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0366  hypothetical protein  41.1 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03020  hypothetical protein  38.89 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5149  hypothetical protein  36.99 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.627977 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5325  hypothetical protein  36.91 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3044  hypothetical protein  41.94 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.766056  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2425  hypothetical protein  31.43 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2922  hypothetical protein  34.27 
 
 
149 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3646  ribosomal protein L28  36.84 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0251  hypothetical protein  32.62 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0530  hypothetical protein  30.09 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>