113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0090 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002530  glutamate--cysteine ligase  72.94 
 
 
522 aa  822    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0090  glutamate--cysteine ligase  100 
 
 
524 aa  1088    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03486  glutamate--cysteine ligase  72.74 
 
 
522 aa  820    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0643  glutamate--cysteine ligase  65.45 
 
 
521 aa  748    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3020  glutamate--cysteine ligase  55.71 
 
 
518 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.427194  hitchhiker  0.0000869019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3003  glutamate--cysteine ligase  55.71 
 
 
518 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.179247  hitchhiker  0.000116011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2968  glutamate--cysteine ligase  55.71 
 
 
518 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209272  hitchhiker  0.00113196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2937  glutamate--cysteine ligase  55.71 
 
 
518 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00247606  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3127  glutamate--cysteine ligase  55.71 
 
 
518 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  0.0373745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02543  glutamate-cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0996  glutamate/cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00172637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3168  glutamate--cysteine ligase  56.06 
 
 
514 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2824  glutamate--cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00050885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2971  glutamate--cysteine ligase  56.06 
 
 
518 aa  586  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000810543  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1019  glutamate--cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.145998  normal  0.0132259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2810  glutamate--cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  586  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000302956  hitchhiker  0.00165416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3934  glutamate--cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.161519  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02508  hypothetical protein  54.74 
 
 
518 aa  587  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0847  glutamate--cysteine ligase  56.66 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000051454  hitchhiker  0.00000388875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0987  glutamate--cysteine ligase  56.69 
 
 
520 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1120  glutamate--cysteine ligase  55.25 
 
 
517 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00403409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3207  glutamate--cysteine ligase  55.25 
 
 
517 aa  579  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3188  glutamate--cysteine ligase  55.67 
 
 
518 aa  580  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00136573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3369  glutamate--cysteine ligase  56.2 
 
 
532 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00208999  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1002  glutamate--cysteine ligase  54.74 
 
 
518 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3234  glutamate--cysteine ligase  56 
 
 
532 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0891  glutamate--cysteine ligase  56.2 
 
 
532 aa  574  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000207295  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0201  glutamate--cysteine ligase  52.56 
 
 
523 aa  556  1e-157  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3373  glutamate--cysteine ligase  50.19 
 
 
526 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1366  glutamate--cysteine ligase  50.1 
 
 
533 aa  511  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1058  glutamate--cysteine ligase  51.53 
 
 
526 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.512666 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2980  glutamate--cysteine ligase  53.57 
 
 
549 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1072  glutamate--cysteine ligase  50.56 
 
 
539 aa  498  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1329  glutamate--cysteine ligase  50.2 
 
 
544 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.423999  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3559  glutamate--cysteine ligase  52.71 
 
 
564 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3062  glutamate--cysteine ligase  53.37 
 
 
549 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1227  glutamate--cysteine ligase  53.19 
 
 
523 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3160  glutamate--cysteine ligase  53.17 
 
 
549 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.768452  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1036  glutamate--cysteine ligase  52.39 
 
 
549 aa  488  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1132  glutamate--cysteine ligase  53.07 
 
 
549 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3260  glutamate--cysteine ligase  53.07 
 
 
549 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1031  glutamate--cysteine ligase  52.87 
 
 
549 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1098  glutamate--cysteine ligase  52.67 
 
 
549 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1219  glutamate--cysteine ligase  51.89 
 
 
524 aa  482  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02763  glutamate cysteine ligase  48.57 
 
 
532 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.969679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4078  glutamate--cysteine ligase  49.31 
 
 
529 aa  481  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.479247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3326  glutamate--cysteine ligase  49.06 
 
 
542 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0015659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1208  glutamate--cysteine ligase  50 
 
 
522 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05020  glutamate--cysteine ligase  44.57 
 
 
530 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.402642  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0243  glutamate--cysteine ligase  44.96 
 
 
525 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0258  glutamate--cysteine ligase  44.96 
 
 
530 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358158  normal  0.0162786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0268  glutamate--cysteine ligase  44.96 
 
 
530 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4969  glutamate--cysteine ligase  45.44 
 
 
525 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5948  glutamate--cysteine ligase  46.39 
 
 
527 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3571  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  44.66 
 
 
518 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3430  glutamate--cysteine ligase  44.25 
 
 
530 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68730  glutamate--cysteine ligase  45.98 
 
 
527 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0356  glutamate--cysteine ligase  45.6 
 
 
526 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0325  glutamate--cysteine ligase  44.79 
 
 
529 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0257  glutamate--cysteine ligase  43.74 
 
 
532 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6505  glutamate--cysteine ligase  44.02 
 
 
537 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104225  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0087  glutamate--cysteine ligase  41.51 
 
 
548 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000417414  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2536  glutamate--cysteine ligase  43.45 
 
 
533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0916365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3149  glutamate--cysteine ligase  43.45 
 
 
533 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0807881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0696  glutamate/cysteine ligase  42.75 
 
 
524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0255  glutamate--cysteine ligase  43.52 
 
 
535 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3583  glutamate-cysteine ligase  42.94 
 
 
530 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.508788 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2654  glutamate-cysteine ligase  44.02 
 
 
536 aa  405  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.440832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3202  glutamate--cysteine ligase  42.71 
 
 
537 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.676712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2324  glutamate/cysteine ligase  44.11 
 
 
528 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.995496  normal  0.291443 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0118  glutamate--cysteine ligase  41.32 
 
 
537 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000414773  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3169  glutamate--cysteine ligase  43.25 
 
 
537 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00288227  hitchhiker  0.00000108947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0110  glutamate/cysteine ligase  46.46 
 
 
532 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0117  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
533 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000417338  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0324  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
548 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000109041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2834  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000012706  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2251  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0100341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0134  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2302  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2325  glutamate--cysteine ligase  41.13 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.82079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3143  glutamate--cysteine ligase  43 
 
 
537 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000827615 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3087  glutamate--cysteine ligase  42.51 
 
 
537 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00169886  normal  0.0244082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2467  glutamate--cysteine ligase  43.22 
 
 
509 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1606  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  42.42 
 
 
519 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.526422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4484  glutamate--cysteine ligase  42.61 
 
 
538 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0203665  unclonable  0.00000138966 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3953  glutamate--cysteine ligase  41.32 
 
 
538 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124779  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0750  glutamate--cysteine ligase  41.58 
 
 
530 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44822  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3086  glutamate--cysteine ligase  40.51 
 
 
547 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0401294  hitchhiker  0.00000000000210379 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3637  glutamate/cysteine ligase  40.65 
 
 
518 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1925  glutamate--cysteine ligase  41.7 
 
 
519 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.196838 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0035  glutamate-cysteine ligase  41.6 
 
 
527 aa  365  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0043  glutamate--cysteine ligase, monofunctional  42.12 
 
 
527 aa  366  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2521  glutamate-cysteine ligase  40.08 
 
 
510 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000545569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1339  glutamate/cysteine ligase  40.08 
 
 
510 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.881569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0046  glutamate--cysteine ligase  40.52 
 
 
526 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2471  glutamate--cysteine ligase  40.12 
 
 
509 aa  359  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3399  glutamate-cysteine ligase  39.39 
 
 
537 aa  356  5.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2262  glutamate-cysteine ligase  40.3 
 
 
518 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0149794  unclonable  0.0000000142325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0465  glutamate--cysteine ligase  42.39 
 
 
518 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0551  glutamate--cysteine ligase  39.77 
 
 
507 aa  345  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.152428 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>