More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0074 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0074  aspartate kinase  100 
 
 
395 aa  812    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03510  aspartate kinase  71.9 
 
 
395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002522  aspartokinase  71.14 
 
 
395 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  43.38 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000937685  decreased coverage  0.000000109716 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  43.24 
 
 
413 aa  301  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  43.32 
 
 
411 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  43.32 
 
 
411 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  43.14 
 
 
411 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  43.03 
 
 
406 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  42.79 
 
 
409 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  44.36 
 
 
408 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  42.39 
 
 
411 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  42.79 
 
 
411 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  42.17 
 
 
428 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000145942  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  42.17 
 
 
428 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000357046  hitchhiker  0.0000374387 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  43.14 
 
 
412 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0636  aspartate kinase  46.65 
 
 
389 aa  292  6e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  43.14 
 
 
412 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3427  aspartokinase  45.91 
 
 
418 aa  292  9e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  43.28 
 
 
412 aa  292  9e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  43 
 
 
410 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  43.03 
 
 
410 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  43.03 
 
 
424 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  42.36 
 
 
410 aa  290  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000124538  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  45.14 
 
 
409 aa  288  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  40.99 
 
 
414 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000147671  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  45.11 
 
 
410 aa  286  5e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  42 
 
 
408 aa  285  8e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000018313  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  42.86 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  42.08 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000967452  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  43 
 
 
401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1199  aspartate kinase  45.16 
 
 
418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000597152  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1128  aspartate kinase  45.16 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000633865  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  44.61 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  44.61 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  41.92 
 
 
400 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000378473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  43.14 
 
 
414 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  43.38 
 
 
409 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1129  aspartate kinase  44.67 
 
 
418 aa  279  5e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000203845  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2609  aspartate kinase  43.4 
 
 
407 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0578539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  41.61 
 
 
427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000435622  hitchhiker  0.0000000129841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2744  aspartate kinase  44.09 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  42.64 
 
 
416 aa  273  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  44 
 
 
416 aa  272  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  41.58 
 
 
408 aa  271  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  42.71 
 
 
399 aa  270  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  41.16 
 
 
400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  41.16 
 
 
400 aa  267  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  39.9 
 
 
400 aa  266  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  42.46 
 
 
399 aa  266  5e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000759653  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1049  aspartate kinase  41.21 
 
 
403 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00683315  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3123  aspartate kinase  45.41 
 
 
418 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00206455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  43.42 
 
 
410 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3114  aspartate kinase  44.67 
 
 
418 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000131076  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3266  aspartate kinase  44.67 
 
 
418 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00158192  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1251  aspartate kinase  44.67 
 
 
418 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000231974  hitchhiker  0.00000000112827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  40.65 
 
 
405 aa  262  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  41.09 
 
 
404 aa  260  3e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08040  aspartate kinase  37.99 
 
 
427 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000887302  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0669  aspartate kinase  39.55 
 
 
400 aa  259  6e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  41.21 
 
 
405 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266682  hitchhiker  0.0000823679 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  42.18 
 
 
411 aa  258  9e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  40.2 
 
 
410 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000423126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  39 
 
 
411 aa  256  7e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  40.96 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  40.96 
 
 
422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  40.2 
 
 
406 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  40.69 
 
 
405 aa  252  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  40.69 
 
 
404 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000223474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  39.65 
 
 
407 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000267569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4889  aspartate kinase  40 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.213019  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5257  aspartate kinase  40 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  39.12 
 
 
418 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4978  aspartate kinase  40 
 
 
421 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.922524  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0991  aspartokinase  42.36 
 
 
409 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000471315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  38.94 
 
 
417 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5504  aspartate kinase  39.75 
 
 
421 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0983688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  40.48 
 
 
422 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  40.38 
 
 
416 aa  250  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000023583  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  39.9 
 
 
416 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  39.5 
 
 
403 aa  249  4e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  38.94 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  39.18 
 
 
416 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  39.9 
 
 
416 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  40 
 
 
422 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2702  aspartate kinase  53.97 
 
 
426 aa  249  6e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  39.67 
 
 
422 aa  248  9e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0884  aspartate kinase  42.11 
 
 
409 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000166262  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  39.66 
 
 
416 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00000763531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  40.72 
 
 
422 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  39.2 
 
 
409 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04060  aspartate kinase  51.97 
 
 
427 aa  247  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.53456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1961  aspartate kinase  40.35 
 
 
409 aa  248  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000119099  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  38.7 
 
 
417 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>