More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0054 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
267 aa  527  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  86.84 
 
 
267 aa  470  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  86.42 
 
 
267 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.27 
 
 
267 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  66.29 
 
 
266 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.12 
 
 
266 aa  329  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.5 
 
 
266 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.36 
 
 
266 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.88 
 
 
266 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.36 
 
 
266 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.98 
 
 
266 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.61 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.61 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.61 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.61 
 
 
266 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.87 
 
 
266 aa  321  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.09 
 
 
266 aa  316  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.23 
 
 
266 aa  315  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.25 
 
 
266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.26 
 
 
266 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  58.71 
 
 
267 aa  296  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.42 
 
 
265 aa  295  5e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.97 
 
 
272 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.92 
 
 
265 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.04 
 
 
266 aa  290  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.92 
 
 
266 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.89 
 
 
266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  54.55 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.28 
 
 
264 aa  264  1e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.1 
 
 
264 aa  259  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.2 
 
 
265 aa  251  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.38 
 
 
265 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  49.82 
 
 
270 aa  215  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  42.75 
 
 
269 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  42.32 
 
 
279 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.29 
 
 
282 aa  202  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
292 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  39.23 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  41.79 
 
 
265 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.66 
 
 
267 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 
282 aa  192  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  43.49 
 
 
269 aa  191  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.5 
 
 
282 aa  192  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  44.62 
 
 
270 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  38.87 
 
 
277 aa  190  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
292 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.58 
 
 
283 aa  188  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  42.69 
 
 
262 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
277 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  37.97 
 
 
285 aa  185  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  38.93 
 
 
289 aa  185  8e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
286 aa  185  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.5 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  39.47 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  42.15 
 
 
258 aa  182  3e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.57 
 
 
282 aa  181  9.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.78 
 
 
276 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
276 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  39.53 
 
 
272 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
282 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  36.73 
 
 
281 aa  180  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  37.79 
 
 
280 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  41.54 
 
 
261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  41.7 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.39 
 
 
286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  38.81 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  40.62 
 
 
281 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  43.23 
 
 
271 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  37.31 
 
 
386 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  39.78 
 
 
273 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.36 
 
 
294 aa  176  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  42.86 
 
 
271 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.56 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  36.84 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  42.48 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  41.09 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  39.26 
 
 
264 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  38.52 
 
 
274 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  40.08 
 
 
302 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.26 
 
 
288 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
267 aa  169  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.92 
 
 
267 aa  168  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.26 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  34.35 
 
 
278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  37.17 
 
 
300 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35 
 
 
276 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35 
 
 
276 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35 
 
 
282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  39.53 
 
 
272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  38.11 
 
 
320 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  34.81 
 
 
290 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  37.55 
 
 
279 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  39.7 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  33.95 
 
 
290 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  38.82 
 
 
290 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
283 aa  160  2e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
320 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.74 
 
 
278 aa  159  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  35.74 
 
 
278 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>