More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3783 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  100 
 
 
271 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  96.68 
 
 
271 aa  495  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  77.61 
 
 
270 aa  417  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  69.66 
 
 
269 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  66.67 
 
 
269 aa  332  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  62.55 
 
 
273 aa  311  6.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  59.18 
 
 
272 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  45.8 
 
 
279 aa  226  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  50.57 
 
 
261 aa  218  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.33 
 
 
265 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  45.17 
 
 
272 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  43.53 
 
 
265 aa  203  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  46.1 
 
 
262 aa  201  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  44.4 
 
 
261 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  42.75 
 
 
264 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
266 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  44.31 
 
 
302 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.28 
 
 
266 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.53 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  43.23 
 
 
267 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.38 
 
 
267 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  43.43 
 
 
266 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.24 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
265 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
266 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.82 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.08 
 
 
264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
266 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.07 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  42.97 
 
 
258 aa  181  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
266 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.77 
 
 
266 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.61 
 
 
264 aa  180  2e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  39.93 
 
 
272 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  43.18 
 
 
267 aa  178  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  37.69 
 
 
320 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
265 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.44 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.12 
 
 
320 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 
267 aa  172  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  36.13 
 
 
322 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  40.47 
 
 
290 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  36.13 
 
 
322 aa  169  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
286 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.29 
 
 
272 aa  168  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  40.08 
 
 
272 aa  167  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.52 
 
 
287 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  38.69 
 
 
279 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  39.77 
 
 
277 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.3 
 
 
260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  38.24 
 
 
274 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  40.23 
 
 
285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  37.79 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.96 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.66 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.35 
 
 
283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.79 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.63 
 
 
292 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  37.92 
 
 
302 aa  161  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.38 
 
 
312 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  37.88 
 
 
386 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
276 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.91 
 
 
282 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.02 
 
 
267 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  40.23 
 
 
274 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
276 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
276 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
282 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.96 
 
 
282 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.62 
 
 
276 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 
259 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
280 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.23 
 
 
282 aa  156  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2440  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 
259 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 
259 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 
259 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.77 
 
 
282 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
269 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2586  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0713308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 
259 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  37.87 
 
 
273 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2732  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 
259 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.74 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.54 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2479  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 
259 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000149761  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.36 
 
 
278 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0723  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.01 
 
 
282 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
267 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>