More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1967 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
288 aa  556  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  64.64 
 
 
320 aa  347  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  62.68 
 
 
320 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  65.4 
 
 
322 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  65.4 
 
 
322 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.18 
 
 
312 aa  291  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.12 
 
 
293 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.15 
 
 
287 aa  285  9e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 
283 aa  276  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.9 
 
 
269 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  48.72 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  49.07 
 
 
291 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  49.07 
 
 
290 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  49.81 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  47.08 
 
 
302 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.88 
 
 
279 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09201  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.13 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0131837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  44.93 
 
 
274 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.34 
 
 
282 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  46.52 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  45.91 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.43 
 
 
286 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.48 
 
 
282 aa  208  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  48.85 
 
 
274 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  45.49 
 
 
273 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  42.6 
 
 
386 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  43.8 
 
 
277 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.06 
 
 
283 aa  205  7e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.05 
 
 
282 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  45.45 
 
 
272 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.9 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.86 
 
 
282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  42.7 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.7 
 
 
282 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.46 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  42.25 
 
 
278 aa  195  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.94 
 
 
280 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.52 
 
 
276 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  42.45 
 
 
281 aa  192  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3201  undecaprenol kinase  48.22 
 
 
296 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.85 
 
 
278 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 
286 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.18 
 
 
277 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2789  undecaprenol kinase  47.23 
 
 
295 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.3 
 
 
276 aa  188  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  43.13 
 
 
281 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.78 
 
 
292 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  40.36 
 
 
280 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.95 
 
 
265 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  38.68 
 
 
289 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10391  bacitracin resistance protein BacA  38.38 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.160543  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09021  bacitracin resistance protein BacA  38.35 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  41.67 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  43.82 
 
 
281 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  44.62 
 
 
281 aa  182  6e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
276 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
276 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
282 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  41.54 
 
 
290 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  40.93 
 
 
279 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
278 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09041  bacitracin resistance protein BacA  37.72 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.47 
 
 
276 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  39.54 
 
 
267 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.54 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0843  undecaprenyl-diphosphatase  39.85 
 
 
268 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.822614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.96 
 
 
265 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.1 
 
 
266 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.18 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.71 
 
 
266 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  38.93 
 
 
278 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  42.7 
 
 
276 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.11 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.97 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.55 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  40.34 
 
 
290 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.6 
 
 
267 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  40 
 
 
290 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.52 
 
 
266 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.26 
 
 
267 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  39.33 
 
 
269 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.54 
 
 
265 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.95 
 
 
266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
266 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
266 aa  165  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  36.57 
 
 
270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.16 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  35.77 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.82 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>