More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1080 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
266 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  85.66 
 
 
266 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  83.83 
 
 
266 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.62 
 
 
266 aa  431  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80 
 
 
266 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.25 
 
 
266 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.25 
 
 
266 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.25 
 
 
266 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  78.87 
 
 
266 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  79.25 
 
 
266 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  78.49 
 
 
266 aa  425  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  78.49 
 
 
266 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  77.36 
 
 
266 aa  418  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  76.89 
 
 
266 aa  417  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  80.24 
 
 
266 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  72.45 
 
 
266 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  62.78 
 
 
267 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.88 
 
 
267 aa  330  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.88 
 
 
267 aa  324  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.74 
 
 
267 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.15 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.65 
 
 
266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  58.85 
 
 
267 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.57 
 
 
272 aa  284  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.87 
 
 
265 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  54.8 
 
 
266 aa  267  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.33 
 
 
265 aa  266  2e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.38 
 
 
266 aa  265  8e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.38 
 
 
265 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.57 
 
 
264 aa  251  6e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50 
 
 
264 aa  246  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.21 
 
 
265 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  52.76 
 
 
270 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  42.05 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  44.94 
 
 
269 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  41.15 
 
 
274 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  42.91 
 
 
270 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  40.38 
 
 
265 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  41.92 
 
 
258 aa  190  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
292 aa  188  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  40.54 
 
 
272 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  40.75 
 
 
285 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  40.15 
 
 
272 aa  186  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
277 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.11 
 
 
282 aa  185  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  35.71 
 
 
386 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.48 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  37.27 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  42.16 
 
 
268 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  40.08 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.47 
 
 
292 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  39.86 
 
 
269 aa  181  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  41.8 
 
 
281 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  38.21 
 
 
289 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.06 
 
 
267 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  41.22 
 
 
261 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.38 
 
 
267 aa  178  9e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  41.29 
 
 
302 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.6 
 
 
276 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.36 
 
 
276 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.54 
 
 
286 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0597  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.5 
 
 
270 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  42.15 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0714  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.38134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4622  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330334 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  38.52 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0649  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0594  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0810  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0683  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0738  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.74 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6963000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  37.64 
 
 
273 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  38.43 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.45 
 
 
294 aa  172  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  40.93 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.29 
 
 
280 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  37 
 
 
300 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
276 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
276 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
282 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  41 
 
 
273 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  38.46 
 
 
280 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
283 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.59 
 
 
278 aa  169  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  42.32 
 
 
271 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
276 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
282 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1705  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
280 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0252604  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.98 
 
 
270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.82 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  37.59 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  37.78 
 
 
290 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.92 
 
 
282 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  41.57 
 
 
271 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
288 aa  165  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0541  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.21 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0858873  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.52 
 
 
282 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>