More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0174 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  100 
 
 
267 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  61.31 
 
 
272 aa  310  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.61 
 
 
267 aa  309  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.7 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.38 
 
 
266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.7 
 
 
266 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  60.61 
 
 
267 aa  308  4e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.71 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.7 
 
 
266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.7 
 
 
266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.74 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.74 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.74 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.74 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.7 
 
 
266 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.62 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.3 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.85 
 
 
266 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.58 
 
 
266 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.1 
 
 
266 aa  298  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.71 
 
 
267 aa  296  3e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.7 
 
 
266 aa  291  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.98 
 
 
265 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.11 
 
 
266 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.5 
 
 
266 aa  278  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.17 
 
 
266 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.13 
 
 
265 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  56.22 
 
 
266 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.15 
 
 
265 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.95 
 
 
264 aa  257  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.42 
 
 
264 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.86 
 
 
265 aa  234  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  42.21 
 
 
277 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  46.42 
 
 
270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  45.28 
 
 
268 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  43.91 
 
 
269 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  39.92 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  42.41 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  45.08 
 
 
270 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  41.25 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  40.07 
 
 
265 aa  177  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  43.53 
 
 
272 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  46.01 
 
 
269 aa  176  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  41.44 
 
 
273 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.22 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.18 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.22 
 
 
282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  39.63 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.42 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  42.69 
 
 
261 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.61 
 
 
292 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  40.45 
 
 
272 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.54 
 
 
282 aa  169  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  41.6 
 
 
272 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.78 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  42.31 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.2 
 
 
267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.31 
 
 
286 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 
286 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.46 
 
 
282 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  45.96 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  43.18 
 
 
271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  37.41 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  39.33 
 
 
290 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.4 
 
 
276 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  41.15 
 
 
258 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.35 
 
 
283 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  42.97 
 
 
271 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
282 aa  158  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
282 aa  158  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  38.46 
 
 
281 aa  158  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  35.58 
 
 
386 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  39.45 
 
 
281 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.06 
 
 
294 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
288 aa  156  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 
267 aa  156  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.41 
 
 
282 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  39.54 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  42.26 
 
 
304 aa  155  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.05 
 
 
282 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  38.06 
 
 
273 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  38.43 
 
 
279 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  40.48 
 
 
302 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.91 
 
 
267 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  37.55 
 
 
280 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.63 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  40.16 
 
 
264 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  45.69 
 
 
272 aa  149  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  41.67 
 
 
290 aa  148  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.3 
 
 
278 aa  148  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10391  bacitracin resistance protein BacA  34.87 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.160543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  39.62 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
278 aa  146  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  35.07 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  36.16 
 
 
281 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  36.67 
 
 
290 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  34.12 
 
 
278 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>