More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1838 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
292 aa  578  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  73.2 
 
 
386 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  63.38 
 
 
286 aa  358  6e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  58.13 
 
 
292 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  57.99 
 
 
279 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  55.96 
 
 
277 aa  311  6.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  56.46 
 
 
272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  56.9 
 
 
290 aa  288  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  53.87 
 
 
274 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.06 
 
 
277 aa  280  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  55.51 
 
 
285 aa  279  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  54.61 
 
 
290 aa  276  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  52.71 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.46 
 
 
277 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  53.51 
 
 
273 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  50 
 
 
289 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  54.3 
 
 
286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  53.31 
 
 
274 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  52.77 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  51.77 
 
 
281 aa  265  7e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  58.37 
 
 
281 aa  262  4e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.54 
 
 
278 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.77 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  48.36 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  50.17 
 
 
290 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.78 
 
 
276 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.78 
 
 
276 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.78 
 
 
282 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.73 
 
 
276 aa  241  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.84 
 
 
282 aa  239  5e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48 
 
 
276 aa  235  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  43.57 
 
 
339 aa  228  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.99 
 
 
276 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.04 
 
 
282 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.84 
 
 
282 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 
278 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.39 
 
 
278 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.34 
 
 
280 aa  215  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.07 
 
 
294 aa  215  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.12 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
282 aa  212  7e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  44.24 
 
 
278 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.2 
 
 
320 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  40.5 
 
 
278 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
282 aa  205  9e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  44.36 
 
 
272 aa  202  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.76 
 
 
282 aa  202  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  42.41 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.6 
 
 
266 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.31 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
272 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.29 
 
 
266 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.47 
 
 
266 aa  192  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  43.56 
 
 
261 aa  191  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.11 
 
 
266 aa  191  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.77 
 
 
267 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.93 
 
 
267 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.58 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  40.54 
 
 
267 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  39.76 
 
 
266 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.97 
 
 
265 aa  188  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  37.32 
 
 
320 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.02 
 
 
266 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.08 
 
 
265 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
266 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 
266 aa  185  9e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  37.74 
 
 
264 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.26 
 
 
266 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.09 
 
 
266 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  41.3 
 
 
304 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  39.38 
 
 
302 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.47 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  39.03 
 
 
290 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  41.44 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  39.62 
 
 
322 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  39.62 
 
 
322 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.93 
 
 
293 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
266 aa  178  9e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
266 aa  178  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.34 
 
 
266 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.17 
 
 
312 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  36.86 
 
 
290 aa  176  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.25 
 
 
265 aa  176  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  37.5 
 
 
273 aa  176  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.96 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.32 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  40.52 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  40.61 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  40.51 
 
 
272 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.16 
 
 
264 aa  171  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  36.26 
 
 
269 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  38.61 
 
 
267 aa  170  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>