More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2821 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_2821  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
267 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184257  normal  0.392162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0247  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.55 
 
 
267 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  67.29 
 
 
267 aa  335  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.7 
 
 
265 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.4 
 
 
264 aa  190  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.83 
 
 
267 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.98 
 
 
266 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
266 aa  186  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  42.02 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.76 
 
 
267 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.61 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.27 
 
 
265 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.13 
 
 
264 aa  177  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.85 
 
 
266 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.46 
 
 
266 aa  176  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  40.77 
 
 
267 aa  175  6e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.31 
 
 
266 aa  175  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  42.91 
 
 
268 aa  175  6e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.34 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 
266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.08 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.42 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.37 
 
 
272 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.45 
 
 
266 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  41.29 
 
 
274 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  42.49 
 
 
267 aa  169  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.35 
 
 
265 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0017  undecaprenyl-diphosphatase  45.42 
 
 
282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.65 
 
 
266 aa  161  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.8 
 
 
265 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  40.75 
 
 
272 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.9 
 
 
282 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.36 
 
 
282 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
282 aa  152  4e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.47 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  39.77 
 
 
261 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  36.74 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.88 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  36.94 
 
 
262 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  36.96 
 
 
302 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  39.92 
 
 
261 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  34.47 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  36.88 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  36.59 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.83 
 
 
282 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.08 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  34.2 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  35.09 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  34.07 
 
 
290 aa  138  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  33.95 
 
 
281 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3344  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.09 
 
 
277 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2096  undecaprenyl-diphosphatase  38.52 
 
 
270 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.76838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  33.72 
 
 
272 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.94 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2042  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.35 
 
 
274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2789  undecaprenol kinase  36.19 
 
 
295 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.57 
 
 
282 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1829  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.35 
 
 
277 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1356  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
277 aa  135  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0826661 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  35.85 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.67 
 
 
292 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3599  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.1 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.47 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2289  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.57 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00352871  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  32.83 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  37.02 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2269  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.09 
 
 
275 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  0.0632294 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  32.83 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  35.85 
 
 
291 aa  132  5e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  34.08 
 
 
277 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1072  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.95 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406664  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.56 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  37.07 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  36.36 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  37.64 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.19 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  31.06 
 
 
291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.47 
 
 
278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.58 
 
 
274 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23354  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  30.86 
 
 
300 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.67 
 
 
261 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000720891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  34.57 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  36.78 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  31.87 
 
 
289 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.45 
 
 
294 aa  126  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  35.82 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  32.2 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.59 
 
 
287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.92 
 
 
269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.58 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.34 
 
 
320 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>