315 genes were found for organism Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rleg_5972  CDS  NC_012852  82  1095  +  1014  rbsB; ABC transporter substrate binding protein (ribose)  YP_002978484  normal  0.118573  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5973  CDS  NC_012852  1161  2711  +  1551  ABC transporter related  YP_002978485  normal  0.7217  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5974  CDS  NC_012852  2701  3720  +  1020  inner-membrane translocator  YP_002978486  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5975  CDS  NC_012852  3723  4721  +  999  inner-membrane translocator  YP_002978487  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5976  CDS  NC_012852  4737  6239  -  1503  glycerol kinase  YP_002978488  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5977  CDS  NC_012852  6387  8111  -  1725  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  YP_002978489  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5978  CDS  NC_012852  8192  8488  -  297  conserved hypothetical conserved membrane protein  YP_002978490  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5979  CDS  NC_012852  8488  9399  -  912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978491  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5980  CDS  NC_012852  9401  10267  -  867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978492  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5981  CDS  NC_012852  10270  11340  -  1071  ABC transporter related  YP_002978493  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5982  CDS  NC_012852  11350  12429  -  1080  ABC transporter related  YP_002978494  normal  0.925238  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5983  CDS  NC_012852  12471  13985  -  1515  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  YP_002978495  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5984  CDS  NC_012852  14105  14878  -  774  transcriptional regulator, DeoR family  YP_002978496  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5985  CDS  NC_012852  14977  15882  -  906  protein of unknown function DUF6 transmembrane  YP_002978497  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5986  CDS  NC_012852  15967  16896  +  930  transcriptional regulator, LysR family  YP_002978498  normal  0.431484  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5987  CDS  NC_012852  16935  17405  -  471  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002978499  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5988  CDS  NC_012852  17503  18024  -  522  protein of unknown function DUF992  YP_002978500  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5989  CDS  NC_012852  18615  18863  +  249  17 kDa surface antigen  YP_002978501  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5990  CDS  NC_012852  18884  19243  +  360  putative signal peptide protein  YP_002978502  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5991  CDS  NC_012852  19326  19490  -  165  protein of unknown function DUF1328  YP_002978503  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5992  CDS  NC_012852  19590  20180  -  591  hypothetical protein  YP_002978504  normal  0.729478  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5993  CDS  NC_012852  20273  20659  -  387  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  YP_002978505  normal  0.337391  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5994  CDS  NC_012852  20766  22388  -  1623  ABC transporter related  YP_002978506  normal  0.273688  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5995  CDS  NC_012852  22593  22922  +  330  hypothetical protein  YP_002978507  normal  0.266406  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5996  CDS  NC_012852  23027  23896  +  870  Aldose 1-epimerase  YP_002978508  normal  0.648016  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5997  CDS  NC_012852  23945  25534  -  1590  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  YP_002978509  normal  0.378354  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5998  CDS  NC_012852  25560  26744  -  1185  secretion protein HlyD family protein  YP_002978510  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_5999  CDS  NC_012852  26877  27524  +  648  transcriptional regulator, TetR family  YP_002978511  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6000  CDS  NC_012852  27777  28964  -  1188  mannonate dehydratase  YP_002978512  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6001  CDS  NC_012852  29007  29729  -  723  transcriptional regulator, GntR family  YP_002978513  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6002  CDS  NC_012852  30003  30407  +  405  hypothetical protein  YP_002978514  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6003  CDS  NC_012852  30464  30715  +  252  hypothetical protein  YP_002978515  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6004  CDS  NC_012852  31041  32315  +  1275  O-antigen polymerase  YP_002978516  normal  0.881514  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6005  CDS  NC_012852  32344  34311  -  1968  polysaccharide biosynthesis protein CapD  YP_002978517  normal  0.104997  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6006  CDS  NC_012852  34483  35142  -  660  sugar transferase  YP_002978518  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6007  CDS  NC_012852  35770  36015  +  246  hypothetical protein  YP_002978519  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6008    NC_012852  36026  36378  +  353      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6009  CDS  NC_012852  36492  37256  -  765  protein of unknown function DUF1355  YP_002978520  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6010  CDS  NC_012852  37324  38328  -  1005  rhamnose ABC transporter, periplasmic rhamnose-binding protein  YP_002978521  normal  0.854065  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6011  CDS  NC_012852  38380  39390  -  1011  inner-membrane translocator  YP_002978522  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6012  CDS  NC_012852  39390  41975  -  2586  ABC transporter related  YP_002978523  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6013  CDS  NC_012852  42259  43491  +  1233  ROK family protein  YP_002978524  normal  0.627937  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6014  CDS  NC_012852  44052  44291  -  240  ribosomal protein S21  YP_002978525  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6015  CDS  NC_012852  44687  45292  +  606  heat shock protein DnaJ domain protein  YP_002978526  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6016  CDS  NC_012852  45368  45586  -  219  transcriptional regulator, XRE family  YP_002978527  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6017  CDS  NC_012852  45725  46795  -  1071  hypothetical protein  YP_002978528  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6018  CDS  NC_012852  46785  49187  -  2403  protein of unknown function DUF214  YP_002978529  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6019  CDS  NC_012852  49184  49843  -  660  ABC transporter related  YP_002978530  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6020    NC_012852  50060  50341  +  282      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6021    NC_012852  50360  50965  -  606      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6022  CDS  NC_012852  51017  51490  -  474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  YP_002978531  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6023  CDS  NC_012852  52029  52595  -  567  hypothetical protein  YP_002978532  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6024  CDS  NC_012852  52727  53389  -  663  hypothetical protein  YP_002978533  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6025  CDS  NC_012852  53790  55682  -  1893  heat shock protein 90  YP_002978534  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6026    NC_012852  56029  56780  -  752      normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6027  CDS  NC_012852  57030  57653  -  624  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  YP_002978535  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6028  CDS  NC_012852  57796  58491  -  696  hypothetical protein  YP_002978536  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6029  CDS  NC_012852  58491  58820  -  330  protein of unknown function DUF182  YP_002978537  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6030  CDS  NC_012852  58837  61179  -  2343  glycoside hydrolase family 3 domain protein  YP_002978538  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6031  CDS  NC_012852  61213  61692  -  480  transcriptional regulator, MarR family  YP_002978539  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6032  CDS  NC_012852  61748  62263  -  516  isochorismatase hydrolase  YP_002978540  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6033  CDS  NC_012852  62263  63312  -  1050  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  YP_002978541  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6034  CDS  NC_012852  63299  64078  -  780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978542  normal  1  normal  0.958438  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6035  CDS  NC_012852  64089  65003  -  915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978543  normal  0.968409  normal  0.596602  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6036  CDS  NC_012852  64993  66069  -  1077  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002978544  normal  1  normal  0.62779  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6037  CDS  NC_012852  66435  68672  -  2238  glycoside hydrolase family 37  YP_002978545  normal  0.930873  normal  0.82415  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6038  CDS  NC_012852  68690  71377  -  2688  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  YP_002978546  normal  0.686786  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6039  CDS  NC_012852  71389  74928  -  3540  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  YP_002978547  normal  0.0887172  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6040  CDS  NC_012852  74925  75449  -  525  (2Fe-2S)-binding domain protein  YP_002978548  normal  0.0163802  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6041  CDS  NC_012852  75446  75571  -  126  hypothetical protein  YP_002978549  normal  0.0354646  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6042  CDS  NC_012852  75802  76938  +  1137  monooxygenase FAD-binding  YP_002978550  normal  0.0233658  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6043  CDS  NC_012852  76935  77732  +  798  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002978551  normal  0.17046  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6044  CDS  NC_012852  77822  78574  +  753  Asp/Glu/hydantoin racemase  YP_002978552  normal  0.368354  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6045  CDS  NC_012852  78633  79274  +  642  N-carbamoylsarcosine amidase  YP_002978553  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6046  CDS  NC_012852  79320  80354  +  1035  hypothetical protein  YP_002978554  normal  0.588241  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6047  CDS  NC_012852  80483  80965  +  483  transcriptional regulator, MarR family  YP_002978555  normal  0.332223  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6048  CDS  NC_012852  81260  81424  +  165  hypothetical protein  YP_002978556  normal  0.540501  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6049  CDS  NC_012852  81501  81635  +  135  hypothetical protein  YP_002978557  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6050  CDS  NC_012852  82003  83262  -  1260  major facilitator superfamily MFS_1  YP_002978558  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6051  CDS  NC_012852  84244  85383  +  1140  sodium/calcium exchanger membrane region  YP_002978559  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6052  CDS  NC_012852  86028  87332  -  1305  replication initiation protein RepC  YP_002978560  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6053  CDS  NC_012852  87487  88467  -  981  plasmid partitioning protein RepB  YP_002978561  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6054  CDS  NC_012852  88543  89739  -  1197  plasmid partitioning protein RepA  YP_002978562  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6055  CDS  NC_012852  90194  90715  +  522  hypothetical protein  YP_002978563  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6056  CDS  NC_012852  90718  90993  -  276  hypothetical protein  YP_002978564  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6057  CDS  NC_012852  91340  91534  -  195  hypothetical protein  YP_002978565  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6058  CDS  NC_012852  91663  93756  -  2094  histidine kinase  YP_002978566  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6059  CDS  NC_012852  93753  94493  -  741  two component transcriptional regulator, winged helix family  YP_002978567  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6060  CDS  NC_012852  94709  95731  +  1023  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002978568  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6061  CDS  NC_012852  95850  96878  +  1029  extracellular solute-binding protein family 1  YP_002978569  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6062  CDS  NC_012852  96947  99169  +  2223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002978570  normal  0.113948  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6063  CDS  NC_012852  99166  100227  +  1062  ABC transporter related  YP_002978571  normal  0.127278  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6064  CDS  NC_012852  100343  100990  +  648  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  YP_002978572  normal  0.219512  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6065  CDS  NC_012852  101088  102095  +  1008  transcriptional regulator, LacI family  YP_002978573  normal  0.247104  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6066  CDS  NC_012852  102163  102690  +  528  NUDIX hydrolase  YP_002978574  normal  0.0725439  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6067  CDS  NC_012852  102844  103425  +  582  NUDIX hydrolase  YP_002978575  normal  0.0114891  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6068  CDS  NC_012852  103514  104641  +  1128  protein of unknown function UPF0052 and CofD  YP_002978576  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6069  CDS  NC_012852  104634  105266  +  633  hypothetical protein  YP_002978577  normal  0.627723  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6070  CDS  NC_012852  105460  106311  +  852  inositol monophosphatase  YP_002978578  normal  0.712503  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Rleg_6071  CDS  NC_012852  106365  106973  +  609  hypothetical protein  YP_002978579  normal  1  normal  1  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 4    << first  < prev  1  2  3  4    next >  last >>