More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6034 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0825  ABC transporter membrane spanning protein  42.67 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  40.4 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1008  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.95 
 
 		 273 aa  176  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.507644  normal  0.428884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  44 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  44 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4637  Ornithine carbamoyltransferase  40.83 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476846  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  37.9 
 
 		 266 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 		 257 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.29 
 
 		 266 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1609  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein, putative  38.21 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0392744  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  37.9 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6836  putrescine ABC transporter membrane protein  40.89 
 
 		 274 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  35.89 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4708  Ornithine carbamoyltransferase  44.89 
 
 		 258 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0199227 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00439076  hitchhiker  0.00000318128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0378  Ornithine carbamoyltransferase  41.26 
 
 		 272 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0255644  hitchhiker  0.00261516 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  42.27 
 
 		 272 aa  168  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  41.84 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  38.62 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2993  ornithine carbamoyltransferase  41.56 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  42.26 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.89 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  41.42 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  39.26 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  40.74 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  37.55 
 
 		 293 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1432  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.215203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0349  ornithine carbamoyltransferase  36.23 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 		 279 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6348  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 279 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2811  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  41.13 
 
 		 279 aa  164  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3018  ornithine carbamoyltransferase  41.13 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.26863  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2385  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2642  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0735295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1015  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.17 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1951  putrescine ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  40 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0631  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  40.69 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0723  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  40.69 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2017  putrescine transport system permease protein  40.69 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.75 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  35.17 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2279  putrescine ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2908  ornithine carbamoyltransferase  40.69 
 
 		 279 aa  161  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3520  ornithine carbamoyltransferase  39.22 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.238195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.57 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.210176  normal  0.100236 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4661  Ornithine carbamoyltransferase  39.09 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.535796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0937  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit PotI  39.51 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.023039  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7680  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  40.25 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.540437  normal  0.115465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2347  Ornithine carbamoyltransferase  37.45 
 
 		 288 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1961  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.5 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  39 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1669  ornithine carbamoyltransferase  39.74 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.343722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1512  ornithine carbamoyltransferase  38.75 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.568163  normal  0.487271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2284  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.13 
 
 		 281 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.408593  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5177  ornithine carbamoyltransferase  36.61 
 
 		 297 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2383  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  38.49 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.46 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1764  ornithine carbamoyltransferase  38.96 
 
 		 273 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1953  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  39.57 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0110  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2175  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.661225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1298  putrescine ABC transporter, permease protein  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2307  putrescine transport system permease protein  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5401  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.61 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.424261  hitchhiker  0.00155673 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2120  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.412651  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  37.35 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1785  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1055  putrescine ABC transporter, permease protein PotI  39.26 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.464145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2306  Ornithine carbamoyltransferase  39.57 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.237978  normal  0.193759 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.710361  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1276  ornithine carbamoyltransferase  39.3 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.719655  normal  0.197685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.82 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  38.2 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5084  ornithine carbamoyltransferase  36.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182213  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  38.26 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48730  polyamine transport protein PotI  38.08 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.907578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>