18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6007 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6007  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5626  hypothetical protein  95.06 
 
 
81 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.550605 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2730  hypothetical protein  53.16 
 
 
93 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122577  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2991  hypothetical protein  53.16 
 
 
95 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.32284  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2151  hypothetical protein  50.63 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0506986 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0363  hypothetical protein  51.25 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0318  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.770839  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0394  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799008  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1816  hypothetical protein  53.16 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0709  hypothetical protein  51.95 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.769929  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3442  hypothetical protein  48.1 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180777  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1383  hypothetical protein  50.63 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0800623  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3146  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3838  hypothetical protein  50.63 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0103581  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2680  hypothetical protein  48.1 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366173  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0308  hypothetical protein  52.46 
 
 
77 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0277  hypothetical protein  50.82 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1685  hypothetical protein  45.45 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>