32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6046 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6046  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  715    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3945  hypothetical protein  47.49 
 
 
350 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.402122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1892  hypothetical protein  47.49 
 
 
350 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3580  hypothetical protein  47.2 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.792546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2138  hypothetical protein  47.34 
 
 
350 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0606225 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2512  hypothetical protein  45.13 
 
 
359 aa  305  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0216  hypothetical protein  43.64 
 
 
346 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000223625  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3930  hypothetical protein  46.3 
 
 
361 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.939193  normal  0.0133603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3788  hypothetical protein  45.4 
 
 
350 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1850  hypothetical protein  44.24 
 
 
361 aa  292  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2312  hypothetical protein  43.03 
 
 
352 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4327  hypothetical protein  43.56 
 
 
346 aa  278  8e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513809  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4039  hypothetical protein  43.56 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0438234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4550  hypothetical protein  42.94 
 
 
346 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.33073  normal  0.671741 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3486  hypothetical protein  43.25 
 
 
346 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000698946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4293  hypothetical protein  43.56 
 
 
347 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3067  hypothetical protein  29.24 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0396  hypothetical protein  23.99 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0394  hypothetical protein  24.71 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11100  leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)  22.79 
 
 
316 aa  60.8  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2684  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  23.12 
 
 
313 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0213  hypothetical protein  22.77 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1671  aminopeptidase (leucyl aminopeptidase, aminopeptidase T) 1  24.21 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2557  aminopeptidase  23.15 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.495596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0528  aminopeptidase  23.5 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2142  aminopeptidase  23.98 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2293  hypothetical protein  21.24 
 
 
309 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.885941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2649  hypothetical protein  21.51 
 
 
319 aa  49.3  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0343  hypothetical protein  22.63 
 
 
318 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1162  hypothetical protein  22.77 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.607054  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3010  Leucyl aminopeptidase (aminopeptidase T)-like protein  23.86 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0472619 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0828  peptidase M29 aminopeptidase II  27.03 
 
 
365 aa  43.5  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>