28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6002 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6002  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  267  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6492  hypothetical protein  73.68 
 
 
132 aa  187  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2672  hypothetical protein  47.06 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0143023  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6776  hypothetical protein  56.1 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4413  hypothetical protein  58.82 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.709838 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5871  hypothetical protein  53.66 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5308  hypothetical protein  47.83 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5537  hypothetical protein  48.72 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.698607  normal  0.0340456 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6187  hypothetical protein  48.65 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6584  hypothetical protein  48.65 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1248  hypothetical protein  48.65 
 
 
97 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6364  hypothetical protein  54.55 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.82209  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5323  hypothetical protein  54.05 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8726  hypothetical protein  52.78 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4647  hypothetical protein  42.19 
 
 
107 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  0.0683447 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2054  hypothetical protein  55.56 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5025  hypothetical protein  57.58 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5768  hypothetical protein  48.72 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715276  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6999  hypothetical protein  52.78 
 
 
79 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3082  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7129  hypothetical protein  54.55 
 
 
85 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2281  hypothetical protein  51.72 
 
 
89 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00495792  hitchhiker  0.000743749 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3809  hypothetical protein  52.94 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0880323  normal  0.230333 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2925  hypothetical protein  42.59 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20270  hypothetical protein  44.44 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0543837  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5257  hypothetical protein  57.58 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2545  hypothetical protein  34.55 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7973  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.675178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>