30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5988 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  100 
 
 		 173 aa  343  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  97.11 
 
 		 173 aa  332  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  69.44 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  47.29 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  46.88 
 
 		 174 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  44.6 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  45.59 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  40.34 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  46.32 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  43.75 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  43.75 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  45.04 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  43.18 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  44.27 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  44.36 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  42.54 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  43.51 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  40.6 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  38.46 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  40.31 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  45.11 
 
 		 175 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  45.86 
 
 		 174 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  38.52 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  45.45 
 
 		 114 aa  87  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  37.88 
 
 		 160 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.29 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  36.64 
 
 		 174 aa  84.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  30.41 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>