31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4808 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  100 
 
 		 171 aa  344  4e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  75 
 
 		 175 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  79.38 
 
 		 174 aa  236  8e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  73.86 
 
 		 173 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  64.58 
 
 		 186 aa  176  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  64.66 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  58.11 
 
 		 160 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  50.97 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  51.68 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  53.15 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  50.32 
 
 		 156 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  51.52 
 
 		 157 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  47.65 
 
 		 174 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  49.63 
 
 		 157 aa  134  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  43.45 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  43.18 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  44.37 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  44.37 
 
 		 174 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  39.49 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  42.64 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  43.44 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  36.81 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  38.67 
 
 		 163 aa  96.3  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  38.24 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  38.06 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  35.07 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  35.04 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  29.22 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  34.69 
 
 		 114 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>