31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2979 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  362  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  81.55 
 
 
186 aa  248  4e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  64.63 
 
 
173 aa  204  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  58.66 
 
 
175 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  63.4 
 
 
171 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  63.58 
 
 
174 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  56.13 
 
 
156 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  53.5 
 
 
156 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  51.3 
 
 
160 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  55.41 
 
 
157 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  49.03 
 
 
156 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  53.73 
 
 
157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  45.75 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  48.46 
 
 
157 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  41.52 
 
 
173 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  40.24 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  39.22 
 
 
190 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  44.19 
 
 
174 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  47.29 
 
 
164 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  41.79 
 
 
176 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  42.75 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  42.75 
 
 
174 aa  99.4  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  39.75 
 
 
169 aa  95.9  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  37.66 
 
 
163 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  41.09 
 
 
174 aa  94.7  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  39.26 
 
 
160 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  38.52 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  36.02 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.74 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  37.96 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  31.4 
 
 
156 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>