30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1802 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  51.28 
 
 		 173 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  47.65 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  50 
 
 		 186 aa  137  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  51.54 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  49.66 
 
 		 156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  46.41 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  48.67 
 
 		 174 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  43.79 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  49.61 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  46 
 
 		 175 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  42.21 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  44.37 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  41.26 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  38.52 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  37.76 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  37.76 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  39.53 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  36.64 
 
 		 173 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  36.42 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  36.43 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  36.05 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  33.81 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  38.41 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  34.31 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  33.59 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  33.79 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  31.68 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  35.92 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>