31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3924 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  90.06 
 
 		 174 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  78.85 
 
 		 171 aa  250  6e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  71.6 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  66.67 
 
 		 186 aa  190  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  62.86 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  56.41 
 
 		 160 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  55.56 
 
 		 157 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  56 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  55.92 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  53.55 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  53.79 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  52.21 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  46 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  43.12 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  45.11 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  44.14 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  44.96 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  44.14 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  42.86 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  40.13 
 
 		 190 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  41.1 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  38.26 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  39.57 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.07 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  38.67 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  35 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  35.77 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  30.52 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  35.79 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  34.52 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>