20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1703 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  303  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3361  hypothetical protein  37.18 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3415  hypothetical protein  41.32 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  30.82 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  31.4 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  29.79 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  28.99 
 
 		 174 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  28.48 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  35.44 
 
 		 114 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  24.56 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  27.22 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  32.99 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  27.22 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  27.78 
 
 		 164 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  25.37 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  24.84 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  25.85 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  24.44 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  30.08 
 
 		 186 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>