31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2736 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  305  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  49.33 
 
 
173 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  48.65 
 
 
174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  48.08 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  45.96 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  45.45 
 
 
189 aa  130  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  45.45 
 
 
174 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  48.98 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  45.51 
 
 
160 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  40.24 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  48.28 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  48.32 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  40.83 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  48.87 
 
 
157 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  48.87 
 
 
186 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  51.37 
 
 
175 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  45.62 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  46.43 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  52.05 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  44.78 
 
 
190 aa  117  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  42.75 
 
 
176 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  45.52 
 
 
174 aa  110  9e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  40.85 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  39.86 
 
 
163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  39.1 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  37.96 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.04 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  38.52 
 
 
174 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  37.59 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  38.38 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  24.44 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>