31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1299 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  90.38 
 
 		 156 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  83.44 
 
 		 157 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  90.37 
 
 		 157 aa  246  6e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  70.62 
 
 		 160 aa  220  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  72.26 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  61.29 
 
 		 173 aa  183  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  50.97 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  56.12 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  56.93 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  56 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  56.85 
 
 		 174 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  46.41 
 
 		 174 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  47.37 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  45.95 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  45.04 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  40.38 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  44.19 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  44.19 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  44.96 
 
 		 189 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  44.96 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  47.29 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  41.1 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  39.13 
 
 		 169 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  41.03 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  38.13 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  35.76 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  38.13 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  41.35 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  26.19 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>