30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3923 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  304  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  90.38 
 
 		 156 aa  287  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  78.34 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  89.63 
 
 		 157 aa  245  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  72.5 
 
 		 160 aa  224  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  71.61 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  58.06 
 
 		 173 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  55.4 
 
 		 186 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  50.32 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  56.2 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  55.92 
 
 		 175 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  54.67 
 
 		 174 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  49.66 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  49.62 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  42.75 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  46.62 
 
 		 174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  39.33 
 
 		 163 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  45.86 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  45.86 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  41.86 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  41.18 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  48.06 
 
 		 164 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  39.72 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  42.18 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  38.97 
 
 		 160 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  38.28 
 
 		 190 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  38.97 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  32.85 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  40.38 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>