30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0708 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  347  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  345  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  85.06 
 
 
174 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  47.29 
 
 
190 aa  135  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  46.62 
 
 
157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  45.93 
 
 
174 aa  119  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  46.62 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  40.48 
 
 
173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  40.7 
 
 
173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  43.61 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  44.14 
 
 
171 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  39.87 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  43.61 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  42.68 
 
 
160 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  41.55 
 
 
176 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  43.7 
 
 
156 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  45.86 
 
 
156 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  43.15 
 
 
156 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  45.11 
 
 
157 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  40.15 
 
 
169 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  42.03 
 
 
182 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  37.04 
 
 
163 aa  94  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  45.21 
 
 
174 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  43.84 
 
 
175 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  37.76 
 
 
174 aa  88.2  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.85 
 
 
157 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  35.23 
 
 
169 aa  84.7  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  36.84 
 
 
160 aa  84.3  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  35.34 
 
 
160 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  40.62 
 
 
114 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>