30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2755 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  310  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  70.15 
 
 		 160 aa  196  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  68.61 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  40.67 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  42.34 
 
 		 174 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  40 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  43.75 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  39.71 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  42.14 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  41.35 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  35.76 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  39.85 
 
 		 174 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  37.35 
 
 		 169 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  39.29 
 
 		 173 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  40.27 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  40.67 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  38.41 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  41.04 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  38.97 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  42.22 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  39.07 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  39.13 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  38.76 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  36.24 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  33.79 
 
 		 174 aa  70.5  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  41.35 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  33.85 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>