31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0154 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  376  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  41.01 
 
 		 189 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  41.07 
 
 		 174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  44.78 
 
 		 157 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  43.23 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  42.42 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  41.48 
 
 		 182 aa  101  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  41.91 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  40.22 
 
 		 175 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  39.71 
 
 		 164 aa  97.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  40.54 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  39.84 
 
 		 174 aa  95.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  42.68 
 
 		 174 aa  94.4  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  40.31 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  40.31 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  37.24 
 
 		 157 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  39.31 
 
 		 156 aa  91.3  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  35.97 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  37.31 
 
 		 169 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  36.91 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  38.28 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  38.06 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  37.23 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  30.07 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  39.8 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  33.56 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  28.68 
 
 		 160 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  28.57 
 
 		 160 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  24.8 
 
 		 156 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>