31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3667 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  100 
 
 
160 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  93.75 
 
 
160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  64.97 
 
 
157 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  45.31 
 
 
164 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  41.98 
 
 
174 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  37.96 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  36.88 
 
 
169 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  39.74 
 
 
163 aa  90.5  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  36.88 
 
 
173 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  35.12 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  36.84 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  37.04 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  37.33 
 
 
173 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  37.91 
 
 
156 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  34.59 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  33.76 
 
 
171 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  40 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  36.69 
 
 
157 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  37.25 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  35.34 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  34.18 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  35.34 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  34.31 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  37.09 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  41 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  33.12 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  33.55 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  31.06 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  28.68 
 
 
190 aa  57.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  25.37 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>