31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1105 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  304  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  80.65 
 
 		 156 aa  235  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  72.5 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  70.62 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  68.75 
 
 		 157 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  73.48 
 
 		 157 aa  201  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  57.86 
 
 		 173 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  58.11 
 
 		 171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  51.75 
 
 		 186 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  56.41 
 
 		 175 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  52.14 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  56.41 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  43.79 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  46.32 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  44.6 
 
 		 173 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  46.92 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  43.36 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  43.4 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  44.96 
 
 		 189 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  44.96 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  43.24 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  42.14 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  44.19 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  35.67 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  40.62 
 
 		 190 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  38.41 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  39.1 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  39.1 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  42.59 
 
 		 114 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  29.32 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>