30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1104 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  82.08 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  63.98 
 
 		 173 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  63.28 
 
 		 175 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  62.5 
 
 		 171 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  66.25 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  56.58 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  53.85 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  56.52 
 
 		 157 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  50.65 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  53.73 
 
 		 157 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  48.34 
 
 		 156 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  49.03 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  48.87 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  41.56 
 
 		 174 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  46.32 
 
 		 173 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  43.06 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  43.06 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  44.85 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  39.22 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  44.03 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  42.11 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  38.16 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  40.29 
 
 		 174 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  38.51 
 
 		 169 aa  87.8  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  38.67 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  36.49 
 
 		 169 aa  84.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  36.76 
 
 		 160 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  36.03 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  38.39 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>