31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2813 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  100 
 
 
164 aa  314  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  49.69 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  50.39 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  44.6 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  42.31 
 
 
189 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  45.71 
 
 
156 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  45.31 
 
 
160 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  42.31 
 
 
174 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  47.29 
 
 
182 aa  103  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  43.06 
 
 
186 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  44.53 
 
 
160 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  44.19 
 
 
160 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  45.32 
 
 
156 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  46.04 
 
 
157 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  45.74 
 
 
157 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  40.14 
 
 
190 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  36.81 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  43.62 
 
 
156 aa  97.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  38.46 
 
 
173 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  43.75 
 
 
157 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  38.28 
 
 
173 aa  94  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  36.81 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  39.53 
 
 
174 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  39.6 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  41.1 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  36.72 
 
 
176 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  32.5 
 
 
163 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  38.6 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  27.78 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>