30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4120 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  303  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  83.44 
 
 		 156 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  78.34 
 
 		 156 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  77.71 
 
 		 157 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  70.97 
 
 		 156 aa  214  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  68.75 
 
 		 160 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  60 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  51.68 
 
 		 171 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  56.52 
 
 		 186 aa  157  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  56.93 
 
 		 182 aa  152  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  55.56 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  54.25 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  48.87 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  44.37 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  43.61 
 
 		 189 aa  110  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  44.14 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  43.61 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  43.51 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  44.88 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  42.64 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  39.86 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  35.95 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  46.09 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  39.84 
 
 		 190 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  39.58 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  33.58 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  39.13 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  36.69 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  39.42 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  35.97 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>