30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4367 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  70.56 
 
 		 173 aa  244  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  70.56 
 
 		 173 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  46.92 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  42.45 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  42.25 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  46.15 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  43.61 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  41.55 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  41.55 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  42.03 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  43.44 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  40.46 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  41.79 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  44.88 
 
 		 157 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  40.6 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  42.11 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  39.86 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  40.91 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  35.82 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  36.99 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  36.72 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  42.11 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  44.76 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  40 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  39.23 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  33.81 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  33.85 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  38.76 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>