31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1803 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_1803  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  298  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1105  hypothetical protein  80.65 
 
 
160 aa  235  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.835042  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3923  hypothetical protein  71.61 
 
 
156 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0786582  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1299  hypothetical protein  72.26 
 
 
156 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0557527  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4120  hypothetical protein  70.97 
 
 
157 aa  214  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50064  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4807  protein of unknown function DUF992  74.63 
 
 
157 aa  202  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4121  hypothetical protein  55.13 
 
 
173 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677647  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4808  protein of unknown function DUF992  53.15 
 
 
171 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2979  hypothetical protein  52.52 
 
 
182 aa  145  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0193461  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1104  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  144  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3924  hypothetical protein  53.55 
 
 
175 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0297886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1298  hypothetical protein  53.55 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0166833  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2736  hypothetical protein  45.71 
 
 
157 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1802  hypothetical protein  42.21 
 
 
174 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4367  hypothetical protein  46.15 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5988  protein of unknown function DUF992  42.54 
 
 
173 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2578  hypothetical protein  44.12 
 
 
174 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0657298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0708  hypothetical protein  44.85 
 
 
174 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.668912  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0699  hypothetical protein  43.7 
 
 
189 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6480  protein of unknown function DUF992  41.67 
 
 
173 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3350  hypothetical protein  41.61 
 
 
174 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2813  protein of unknown function DUF992  43.41 
 
 
164 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2802  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.431117  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0154  hypothetical protein  40.15 
 
 
190 aa  88.6  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0057  hypothetical protein  35.85 
 
 
169 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.822764  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2755  hypothetical protein  40.27 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3667  protein of unknown function DUF992  34.18 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0346751  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2735  hypothetical protein  33.57 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4145  hypothetical protein  41.96 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.767445 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3365  protein of unknown function DUF992  35.29 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1703  hypothetical protein  25.76 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>