More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5975 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5975  inner-membrane translocator  100 
 
 		 332 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6462  Monosaccharide-transporting ATPase  92.17 
 
 		 333 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262291  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5169  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  67.66 
 
 		 333 aa  355  6.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2993  ribose ABC transporter, permease protein, putative  54.24 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2874  inner-membrane translocator  52.05 
 
 		 328 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2761  ribose ABC transporter, permease protein, putative  50.76 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2992  inner-membrane translocator  50.76 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.958418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0021  ribose ABC transporter, permease protein  53.12 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1423  carbohydrate ABC transporter permease  53.12 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1510  carbohydrate ABC transporter permease  52.78 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1029  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2367  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  50.17 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0138  carbohydrate ABC transporter permease  52.78 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0417  carbohydrate ABC transporter permease  52.78 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1163  carbohydrate ABC transporter permease  52.78 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294044  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1179  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.78 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.965125  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4170  monosaccharide-transporting ATPase  43.17 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43590  inner-membrane translocator  52.4 
 
 		 327 aa  232  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  40.58 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  34.88 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.63 
 
 		 350 aa  152  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 328 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  35.78 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  34.55 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  34.55 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.55 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.41 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 314 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  32.21 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  31.66 
 
 		 332 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  35.83 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  32.45 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2907  Monosaccharide-transporting ATPase  35.39 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357751 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.74 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  35.51 
 
 		 355 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.74 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7366  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  33.99 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  36.52 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  33.14 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  34.38 
 
 		 334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 350 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  34.41 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0774  inner-membrane translocator  34.36 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0308372 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  32.72 
 
 		 322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  29.08 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  32.84 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  32.65 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  29.08 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0843  Monosaccharide-transporting ATPase  31.76 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3219  monosaccharide-transporting ATPase  29.38 
 
 		 331 aa  132  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1133  monosaccharide-transporting ATPase  32.47 
 
 		 359 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000291616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  32.52 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 		 835 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  31.8 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0406  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  34.59 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  31.85 
 
 		 365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  33.86 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1962  monosaccharide-transporting ATPase  32.63 
 
 		 353 aa  130  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0698409  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33.54 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1852  ribose ABC transporter, permease protein  32.63 
 
 		 353 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0165  monosaccharide-transporting ATPase  31.58 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 342 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  32.14 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  33.45 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  32.14 
 
 		 345 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2404  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.72307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3234  Monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0249  inner-membrane translocator  34.97 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  32.59 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  30.72 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  34.07 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  36.51 
 
 		 354 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  31.95 
 
 		 342 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 356 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1852  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  32.32 
 
 		 331 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  31.63 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.27 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  31 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  31.67 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3229  monosaccharide-transporting ATPase  32.53 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  30.99 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>