More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0021 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0021  ribose ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 326 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1423  carbohydrate ABC transporter permease  100 
 
 		 326 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1163  carbohydrate ABC transporter permease  99.39 
 
 		 326 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294044  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0138  carbohydrate ABC transporter permease  99.39 
 
 		 326 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.163696  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0417  carbohydrate ABC transporter permease  99.39 
 
 		 326 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1510  carbohydrate ABC transporter permease  99.39 
 
 		 326 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1179  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.08 
 
 		 326 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.965125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2993  ribose ABC transporter, permease protein, putative  55.75 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2874  inner-membrane translocator  55.56 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5975  inner-membrane translocator  52.75 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2367  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  53.21 
 
 		 325 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1029  inner-membrane translocator  53.21 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6462  Monosaccharide-transporting ATPase  51.78 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262291  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5169  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  50.16 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4170  monosaccharide-transporting ATPase  45.57 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2992  inner-membrane translocator  54.64 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.958418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2761  ribose ABC transporter, permease protein, putative  54.64 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.949607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43590  inner-membrane translocator  53.82 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2721  inner-membrane translocator  39.1 
 
 		 332 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  32.89 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  34.84 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  36.8 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  34.84 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3061  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 835 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4657  Monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.629166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3637  inner-membrane translocator  28.67 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  31.31 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2782  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0907  methylthioribose transport system permease protein  27.59 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2826  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700859  normal  0.0291669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2809  inner-membrane translocator  32.36 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0829098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  31.99 
 
 		 348 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3767  monosaccharide-transporting ATPase  32.31 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  28.47 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 311 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  30.85 
 
 		 316 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  29.7 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  29.7 
 
 		 311 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  30.62 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  29.7 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  29.7 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  29.7 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  29.7 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  29.37 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2368  ABC sugar (ribose) transporter, inner membrane subunit  34.73 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.163977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1028  inner-membrane translocator  34.73 
 
 		 336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3523  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 355 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0362  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  29.79 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  33.01 
 
 		 333 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  31.49 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  33.11 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  31.06 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  33.77 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  31.54 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  32.27 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  32.4 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  31.79 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  28.39 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  30.34 
 
 		 324 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  26.82 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  29.22 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0038  inner-membrane translocator  34.7 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4756  inner-membrane translocator  32.17 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0208459  normal  0.704824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  28.96 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  34.64 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  29.25 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2648  inner-membrane translocator  29.1 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1619  Monosaccharide-transporting ATPase  32.48 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  29.97 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2852  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.387266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1738  inner-membrane translocator  28.75 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0659  ribose ABC transporter, permease  27.9 
 
 		 329 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.717922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  29.79 
 
 		 345 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  28.97 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0663  monosaccharide-transporting ATPase  28.53 
 
 		 331 aa  109  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  34.71 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2903  inner-membrane translocator  27.8 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0439  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  29.08 
 
 		 314 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2339  inner-membrane translocator  33.03 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  26.32 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  32.2 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0638  monosaccharide-transporting ATPase  27.16 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0715262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0156  sugar ABC transporter permease  30.38 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  27.81 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2424  ribose ABC transporter, permease protein  29.07 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2521  monosaccharide-transporting ATPase  29.07 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3078  ribose ABC transporter permease  29.07 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>