217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3153 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  60.67 
 
 		 291 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  56.72 
 
 		 326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  55.47 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  45.94 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 278 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  39.49 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  42.12 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  40.64 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  40.57 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  42.55 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  41.26 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  40.21 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  38.91 
 
 		 282 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  41.13 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.64 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 280 aa  149  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  34.91 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  36.56 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  41.04 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  38.62 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  40.07 
 
 		 301 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  38.75 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  39.19 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  39.03 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  36.57 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  34.06 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  40.73 
 
 		 287 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  36 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  35.53 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  38.71 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  34.98 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6984  helix-turn-helix domain protein  34.21 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.118873  normal  0.27222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  36.33 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  36.56 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 342 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 276 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 288 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  36.52 
 
 		 309 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  38.77 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  34.17 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  35.77 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  36.03 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5465  XRE family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4092  XRE family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  37.18 
 
 		 281 aa  125  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  34.96 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0169  helix-turn-helix domain-containing protein  38.85 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4269  helix-turn-helix domain protein  36.13 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0718578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  40.61 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1824  transcriptional regulator, XRE family  33.46 
 
 		 259 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 283 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3579  helix-turn-helix domain protein  34.59 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2804  putative transcriptional regulator, XRE family  37.23 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.242118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  35.87 
 
 		 291 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  35.47 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.15 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  36.21 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  35.54 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0930  helix-turn-helix domain-containing protein  34.18 
 
 		 297 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 299 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  36.64 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2807  transcriptional regulator, XRE family  36.5 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31240  Helix-turn-helix protein  35.36 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19630  Helix-turn-helix protein  37.17 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.879989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  33.95 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  36.07 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  34.56 
 
 		 283 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  39.18 
 
 		 265 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  37.06 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1979  transcriptional regulator, XRE family  33.59 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  35.86 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19300  Helix-turn-helix protein  34.63 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>