More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1493 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1995  ABC transporter related protein  63.8 
 
 
635 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589214  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1493  ABC transporter related protein  100 
 
 
605 aa  1147    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.625489  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  65.4 
 
 
606 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391072  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2231  ABC transporter related  55.02 
 
 
608 aa  524  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  50.34 
 
 
584 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4360  ABC transporter related  52.57 
 
 
610 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  49.07 
 
 
613 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2928  ABC transporter, HlyB/MsbA family  48.73 
 
 
602 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.807188  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  50.77 
 
 
608 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3184  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
671 aa  495  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0347906  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  47.25 
 
 
589 aa  491  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3228  ABC transporter related protein  50.09 
 
 
591 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.22 
 
 
617 aa  479  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1925  ABC transporter related  47.05 
 
 
726 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3034  ABC transporter related  46.21 
 
 
597 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.624415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  47.93 
 
 
638 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3407  ABC transporter related  47.46 
 
 
625 aa  444  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3979  ABC transporter related protein  45 
 
 
609 aa  437  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3181  ABC transporter related  48.3 
 
 
625 aa  435  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27260  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.2 
 
 
730 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0467711  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3763  ABC transporter related  40.31 
 
 
984 aa  289  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.849502  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  29.59 
 
 
594 aa  270  7e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
581 aa  263  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  32.44 
 
 
604 aa  246  6e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  30.91 
 
 
575 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.34 
 
 
614 aa  243  9e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6331  ABC transporter related protein  29.54 
 
 
593 aa  240  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  33.44 
 
 
626 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.76 
 
 
593 aa  239  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  31.18 
 
 
584 aa  239  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  34.27 
 
 
600 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  35.88 
 
 
654 aa  237  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  30.74 
 
 
593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  27.89 
 
 
578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5296  ABC transporter related  35.05 
 
 
1522 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  30.78 
 
 
572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  37.81 
 
 
577 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  27.89 
 
 
578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
588 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.18 
 
 
632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  30.78 
 
 
572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  31.3 
 
 
586 aa  233  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1399  ABC transporter related  28 
 
 
596 aa  233  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0150403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
628 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.55 
 
 
578 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.16 
 
 
582 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  30.59 
 
 
572 aa  232  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1747  ABC transporter related  35.04 
 
 
633 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  29.41 
 
 
597 aa  231  3e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  29.81 
 
 
572 aa  231  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  29.41 
 
 
597 aa  231  3e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.59 
 
 
572 aa  231  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4827  ABC transporter related  36.06 
 
 
641 aa  230  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  28.4 
 
 
571 aa  230  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  33 
 
 
640 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  33.59 
 
 
640 aa  229  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.38 
 
 
571 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4445  ABC transporter related  35.73 
 
 
650 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  33.95 
 
 
589 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4532  ABC transporter related  35.73 
 
 
650 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.329885  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  29.38 
 
 
584 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.4 
 
 
627 aa  229  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1527  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.93 
 
 
583 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000068224  normal  0.0160933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  34.13 
 
 
580 aa  228  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5527  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
604 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0203  ABC transporter related  28.09 
 
 
628 aa  227  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000017604  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.29 
 
 
582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1440  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.531129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 
571 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.88 
 
 
622 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  28.21 
 
 
571 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 
571 aa  226  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  32.31 
 
 
695 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.21 
 
 
571 aa  226  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  28.21 
 
 
571 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.21 
 
 
571 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  28.34 
 
 
589 aa  226  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  30.83 
 
 
586 aa  226  8e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  37.5 
 
 
1231 aa  226  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0460  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.02 
 
 
581 aa  226  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3787  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.76 
 
 
583 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  33.99 
 
 
648 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  31.58 
 
 
582 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  35.51 
 
 
582 aa  225  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.64 
 
 
577 aa  225  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.25 
 
 
583 aa  225  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  29.14 
 
 
577 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  32.57 
 
 
687 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.93 
 
 
598 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  31.08 
 
 
576 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  35.09 
 
 
620 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.12 
 
 
618 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 
579 aa  223  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  30.58 
 
 
579 aa  223  7e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.67 
 
 
606 aa  223  7e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1657  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.46 
 
 
555 aa  223  7e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0650  ABC transporter related  29.8 
 
 
577 aa  223  8e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.430432  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.8 
 
 
571 aa  223  9e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4712  ABC transporter related  34.69 
 
 
631 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.576376  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>