More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1153 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0211  ABC-1 domain protein  73.27 
 
 
453 aa  650    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1153  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  949    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2802  hypothetical protein  71.75 
 
 
453 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.193583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3146  hypothetical protein  73.66 
 
 
455 aa  652    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2880  ABC-1 domain protein  71.43 
 
 
456 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00208044  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2757  hypothetical protein  70.09 
 
 
456 aa  630  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2984  ABC-1 domain protein  69.87 
 
 
456 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1076  hypothetical protein  67.48 
 
 
453 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329046  normal  0.448714 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2053  hypothetical protein  66.37 
 
 
461 aa  609  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000184896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3257  ABC-1 domain protein  67.7 
 
 
456 aa  600  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0883  hypothetical protein  59.12 
 
 
455 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.294077 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2193  Abc1 protein  57.4 
 
 
452 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1481  hypothetical protein  53.09 
 
 
452 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.853586  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0328  ABC-1 domain protein  53.32 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.170682 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4216  hypothetical protein  36.28 
 
 
440 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2816  hypothetical protein  31.32 
 
 
434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4322  hypothetical protein  32.75 
 
 
466 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245057  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0409  hypothetical protein  31.2 
 
 
458 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4216  hypothetical protein  33.63 
 
 
469 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332762  normal  0.739533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3788  hypothetical protein  36.25 
 
 
574 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.75918  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4382  ABC-1 domain-containing protein  31.24 
 
 
448 aa  164  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13218  ATP-binding protein ABC transporter  34.48 
 
 
447 aa  162  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.514714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3042  ABC-1 domain protein  30.98 
 
 
438 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.166576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0938  hypothetical protein  31.36 
 
 
543 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0169298  normal  0.687676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1051  ABC-1 domain protein  32.95 
 
 
462 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.193182  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1411  hypothetical protein  34.39 
 
 
445 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.644627  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1429  hypothetical protein  34.39 
 
 
445 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1465  hypothetical protein  34.39 
 
 
445 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4038  hypothetical protein  32.51 
 
 
451 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3305  putative ubiquinol-cytochrome-c reductase assembly protein  32.51 
 
 
451 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5541  hypothetical protein  29.81 
 
 
473 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0141158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3738  ABC-1 domain protein  35.6 
 
 
455 aa  159  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5542  hypothetical protein  29.83 
 
 
476 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0149427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0889  hypothetical protein  26.91 
 
 
440 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  41.27 
 
 
558 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1810  hypothetical protein  30.59 
 
 
445 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.539827  normal  0.0402185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1519  hypothetical protein  38.11 
 
 
483 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8354  ABC1 family protein  34.21 
 
 
445 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114223  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1130  hypothetical protein  28.61 
 
 
446 aa  156  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1656  hypothetical protein  35.09 
 
 
485 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3825  ABC-1 domain protein  37.13 
 
 
481 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.197309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3896  ABC-1 domain protein  32.08 
 
 
477 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3492  ABC-1 domain protein  34.1 
 
 
438 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2961  ABC transporter-like protein  33.44 
 
 
437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.231531  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07600  predicted unusual protein kinase  30.32 
 
 
448 aa  153  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.364742  normal  0.439478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4228  ABC-1 domain protein  31.32 
 
 
440 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0934  ABC-1 domain protein  35.76 
 
 
436 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.365672  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1592  ABC-1 domain protein  35.78 
 
 
443 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.74344  normal  0.15774 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0837  hypothetical protein  30.24 
 
 
432 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4658  hypothetical protein  30.71 
 
 
445 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571674  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1737  ABC-1 domain protein  32.66 
 
 
454 aa  151  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.169861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3948  ABC-1 domain protein  33.44 
 
 
454 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234521  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3736  hypothetical protein  29.38 
 
 
448 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607529  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3301  hypothetical protein  30.36 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.844071 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1965  ABC-1 domain protein  34.01 
 
 
564 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.564803  normal  0.247852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000564  putative ABC transporter  26.81 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00203644  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0987  protein kinase  25.24 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.290468  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2406  hypothetical protein  29.82 
 
 
468 aa  147  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0438  ABC-1 domain protein  35.35 
 
 
473 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1769  hypothetical protein  34.85 
 
 
451 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.967615 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05324  hypothetical protein  28.92 
 
 
440 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0767  hypothetical protein  30.75 
 
 
432 aa  143  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275646  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4117  hypothetical protein  27.68 
 
 
499 aa  143  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278989  normal  0.434139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  35.66 
 
 
558 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  36.47 
 
 
557 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6206  ABC-1 domain protein  33.03 
 
 
454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0457  ABC-1 domain protein  35.58 
 
 
475 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  35.47 
 
 
557 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3886  unusual protein kinase-like  26.9 
 
 
480 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  38.61 
 
 
557 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5833  ABC-1 domain protein  26.18 
 
 
440 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84733  normal  0.500952 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3369  hypothetical protein  29.93 
 
 
457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.413428  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  30.89 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.34 
 
 
557 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3445  ABC-1 domain protein  35.39 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13150  predicted protein  31.99 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.561954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3754  ABC-1 domain protein  30.05 
 
 
447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0940  hypothetical protein  29.77 
 
 
433 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3125  hypothetical protein  31.63 
 
 
441 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  0.167707 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4701  ABC-1 domain protein  31.93 
 
 
576 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.45 
 
 
549 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2048  ABC-1 domain protein  36.11 
 
 
470 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  28.21 
 
 
555 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1477  hypothetical protein  28.9 
 
 
433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533702  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0964  hypothetical protein  33.98 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0852448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  32.58 
 
 
559 aa  134  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2382  ABC-1 domain protein  32.4 
 
 
557 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.423464  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  34.85 
 
 
559 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  27.27 
 
 
537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4248  ABC-1 domain protein  34.24 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00077859  hitchhiker  0.0000000999881 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.83 
 
 
556 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1924  ABC-1 domain protein  26.98 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  30.4 
 
 
563 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4721  hypothetical protein  27.61 
 
 
562 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  31.29 
 
 
555 aa  131  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35328  predicted protein  30.29 
 
 
640 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.678268 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  26.75 
 
 
537 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4587  hypothetical protein  28.86 
 
 
610 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0690861  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2582  ABC-1 domain protein  36.24 
 
 
583 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0170  hypothetical protein  29.82 
 
 
588 aa  130  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>