More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1063 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1063  integrase family protein  100 
 
 
359 aa  725    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1070  integrase family protein  99.44 
 
 
365 aa  720    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4142  integrase family protein  61.56 
 
 
401 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3983  integrase family protein  65.25 
 
 
391 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1142  integrase family protein  57.63 
 
 
399 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441894  hitchhiker  0.0000269765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1348  phage integrase family protein  53.04 
 
 
391 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2203  integrase family protein  56.23 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  52.23 
 
 
390 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  51.67 
 
 
400 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0244  integrase family protein  56.7 
 
 
408 aa  349  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0580  putative phage integrase  52.25 
 
 
438 aa  342  8e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5749  integrase family protein  56.25 
 
 
407 aa  333  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857054  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3606  integrase family protein  54.08 
 
 
420 aa  329  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5109  integrase family protein  54.37 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0410  putative phage integrase  50 
 
 
397 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.980223  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  47.09 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0409  putative phage integrase  48.88 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1896  putative integrase prophage protein  50.57 
 
 
411 aa  312  4.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.240804  normal  0.815259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2309  phage integrase family protein  50.28 
 
 
410 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.733964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1604  phage integrase family protein  48.86 
 
 
459 aa  310  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  46.61 
 
 
419 aa  308  6.999999999999999e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0341  integrase family protein  48.1 
 
 
436 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2480  integrase family protein  48.45 
 
 
397 aa  295  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2013  integrase  49.15 
 
 
409 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0417759  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0151  phage integrase  45.36 
 
 
429 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  45.66 
 
 
398 aa  289  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0275  phage integrase family protein  46.37 
 
 
407 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4522  phage integrase  44.83 
 
 
429 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.292224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0253  integrase family protein  49.15 
 
 
412 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5029  phage integrase family protein  48.41 
 
 
450 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440555  normal  0.789511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0966  phage integrase  46.18 
 
 
410 aa  279  5e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0357996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0970  phage integrase family protein  44.16 
 
 
406 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  43.94 
 
 
411 aa  271  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2283  integrase family protein  44.94 
 
 
417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  45.51 
 
 
415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6554  integrase family protein  44.69 
 
 
411 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000624371  hitchhiker  0.00796568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1500  phage integrase family protein  40.72 
 
 
432 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00572573  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1496  phage integrase  42.22 
 
 
343 aa  257  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.864475  normal  0.0288639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1116  phage integrase family protein  40.11 
 
 
434 aa  246  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0425544  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2749  P4 family integrase  43.62 
 
 
439 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0847  phage integrase  41.62 
 
 
403 aa  225  8e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237314  normal  0.433067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1298  integrase  39.66 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4951  putative prophage integrase  38.12 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229116  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2277  phage integrase family site specific recombinase  39.44 
 
 
402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0249375  normal  0.0747113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02454  integrase  49.34 
 
 
228 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1022  putative phage integrase  49.58 
 
 
279 aa  209  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0239  phage integrase  36.69 
 
 
384 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1546  phage integrase  35.91 
 
 
387 aa  164  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226246  normal  0.34056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0229  phage integrase  34.45 
 
 
401 aa  153  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  31.83 
 
 
409 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3231  phage integrase  35.54 
 
 
362 aa  143  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  30.28 
 
 
414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  33.61 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  29.12 
 
 
422 aa  133  6e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  33.24 
 
 
420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  29.81 
 
 
416 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  31.77 
 
 
410 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  29.59 
 
 
413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  32.34 
 
 
406 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  32.87 
 
 
406 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  29.4 
 
 
412 aa  126  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  29.66 
 
 
415 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  32.89 
 
 
425 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  33.07 
 
 
421 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  29.19 
 
 
416 aa  124  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  29.97 
 
 
410 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  29.01 
 
 
418 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  29.6 
 
 
419 aa  123  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  30.68 
 
 
413 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  30.03 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  28.73 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  30.41 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  32.79 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  31.87 
 
 
411 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  30.17 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  28.02 
 
 
415 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  29.95 
 
 
402 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  29.63 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  28.49 
 
 
387 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  27.62 
 
 
418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  31.17 
 
 
391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  31.85 
 
 
367 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  31.78 
 
 
397 aa  117  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  27.58 
 
 
413 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  28.97 
 
 
416 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  31.04 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  31.5 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  29.4 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  28 
 
 
418 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  32.22 
 
 
403 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3163  integrase family protein  31.59 
 
 
429 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0193699 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  32.32 
 
 
433 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  29.47 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  32.55 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  29.14 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  31.06 
 
 
403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  29.22 
 
 
394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  27.86 
 
 
413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  29.27 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  28.06 
 
 
404 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>