More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0465 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  56.04 
 
 
758 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  53.75 
 
 
732 aa  728    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  56.93 
 
 
758 aa  685    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
743 aa  1447    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  55.14 
 
 
731 aa  736    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  56.79 
 
 
733 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  53.92 
 
 
735 aa  740    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  54.42 
 
 
731 aa  734    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  58.71 
 
 
749 aa  722    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  49.04 
 
 
738 aa  604  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  48.48 
 
 
728 aa  576  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  44.32 
 
 
752 aa  561  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  49.32 
 
 
809 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
762 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  45.17 
 
 
755 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  45.97 
 
 
761 aa  544  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  43.91 
 
 
752 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
724 aa  534  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  44.63 
 
 
757 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  47.16 
 
 
746 aa  535  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  48.71 
 
 
648 aa  526  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  47.36 
 
 
732 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  46.4 
 
 
721 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  48.36 
 
 
727 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  43.68 
 
 
787 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  48.1 
 
 
737 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  48.01 
 
 
729 aa  511  1e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  48.02 
 
 
737 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
737 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  46.4 
 
 
731 aa  502  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
707 aa  463  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.87 
 
 
803 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
803 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 
803 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
807 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.31 
 
 
795 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.94 
 
 
799 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
799 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
806 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.03 
 
 
799 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  36.39 
 
 
799 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
794 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  38.52 
 
 
815 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
799 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
799 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 
799 aa  439  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.52 
 
 
838 aa  436  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
797 aa  434  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.63 
 
 
824 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  40.5 
 
 
882 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  40.86 
 
 
811 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
826 aa  430  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  40.86 
 
 
811 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  39.5 
 
 
846 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  39.67 
 
 
824 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
813 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
792 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.01 
 
 
790 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 
814 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
792 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
791 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.21 
 
 
824 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  39.83 
 
 
765 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
816 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
787 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
819 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
823 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.53 
 
 
812 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  38.59 
 
 
802 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  33.52 
 
 
791 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 
834 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  35.22 
 
 
794 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
818 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  31.54 
 
 
820 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  34.13 
 
 
787 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.64 
 
 
808 aa  382  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
802 aa  382  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 
775 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.24 
 
 
828 aa  379  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
760 aa  379  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.38 
 
 
807 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
806 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.59 
 
 
814 aa  372  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
839 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 
807 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
830 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.2 
 
 
809 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 
806 aa  365  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
824 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.2 
 
 
796 aa  364  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.5 
 
 
793 aa  364  4e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  36.46 
 
 
805 aa  363  5.0000000000000005e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.52 
 
 
797 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  38.34 
 
 
777 aa  363  9e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 
798 aa  359  8e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  27.8 
 
 
806 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 
807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
793 aa  356  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.11 
 
 
732 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>