More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2122 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2122  inner-membrane translocator  100 
 
 		 320 aa  602  1.0000000000000001e-171  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411108  normal  0.923163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2209  monosaccharide-transporting ATPase  67.88 
 
 		 327 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.230129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2597  inner-membrane translocator  52.53 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443228  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3567  monosaccharide-transporting ATPase  49.84 
 
 		 332 aa  292  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0461102  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2431  (monosaccharide) transport system permease protein  51.14 
 
 		 328 aa  291  9e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6269  ABC transporter membrane spanning protein  49.04 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.661725  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4073  inner-membrane translocator  47.9 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0228  monosaccharide-transporting ATPase  48.87 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283799  normal  0.0894894 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6713  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 335 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.756664  normal  0.773263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5812  Monosaccharide-transporting ATPase  47.93 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  40.91 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0417  Monosaccharide-transporting ATPase  39.42 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00113975  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2460  inner-membrane translocator  41.59 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1214  monosaccharide-transporting ATPase  39.22 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1037  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.28 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.006855  normal  0.904347 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5682  Monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.788533 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3461  monosaccharide-transporting ATPase  39.49 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0582  monosaccharide-transporting ATPase  34.63 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000210774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  38.16 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 311 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  35.69 
 
 		 312 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  38.05 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  38.05 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2727  monosaccharide-transporting ATPase  39.55 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0710  inner-membrane translocator  35.76 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  38.05 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  36.67 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  36.33 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  36.33 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  36 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  36 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  36 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  36 
 
 		 311 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2302  inner-membrane translocator  38.24 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.672393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1682  inner-membrane translocator  41.22 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0152598  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4849  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 325 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6011  inner-membrane translocator  37.42 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  34.89 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7831  sugar ABC transporter membrane protein  36.67 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  36.81 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.65 
 
 		 345 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  35.67 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3417  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 316 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.254798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0290  monosaccharide-transporting ATPase  34.81 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3043  Monosaccharide-transporting ATPase  38.31 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.152041  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3181  monosaccharide-transporting ATPase  37.09 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793432 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  34.08 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5198  Monosaccharide-transporting ATPase  34.98 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  33 
 
 		 347 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1397  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0163625  normal  0.0606309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  36.9 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  32.01 
 
 		 333 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2977  putative ribose ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5277  Monosaccharide-transporting ATPase  35.6 
 
 		 337 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2714  sugar ABC transporter, permease  33.44 
 
 		 338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.953176  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  33.33 
 
 		 350 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 340 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2265  putative ribose ABC transporter, permease protein  34.42 
 
 		 329 aa  152  7e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0836743 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  32.66 
 
 		 309 aa  152  8.999999999999999e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  36.63 
 
 		 328 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2131  Monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.441175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2143  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1597  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  36.69 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1657  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  36.69 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.924695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3047  inner-membrane translocator  32.5 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.853041  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  30.94 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2128  autoinducer-2 ABC transporter, permease protein LsrD  36.36 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.22 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  30.87 
 
 		 306 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2764  ribose ABC transporter permease  33.12 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2976  ribose ABC transporter permease  33.12 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 		 310 aa  149  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 314 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2694  sugar ABC transporter, permease  33.12 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2788  ABC-type transporter for ribose/xylose/arabinose/galactoside systems, permease protein  33.22 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0544071  normal  0.614175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 339 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3312  Monosaccharide-transporting ATPase  39.16 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158011 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  35.05 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  31.85 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2606  Monosaccharide-transporting ATPase  37.58 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.331878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2247  L-arabinose transporter permease protein  31.13 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000358536 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  31.21 
 
 		 333 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2414  monosaccharide-transporting ATPase  35.86 
 
 		 360 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346544  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  32.52 
 
 		 322 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  30.72 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0974  monosaccharide-transporting ATPase  32.29 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000416928  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2158  inner-membrane translocator  35.55 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0784619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2433  ribose ABC transporter, permease protein  39 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19854  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4626  Monosaccharide-transporting ATPase  34.01 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.530699 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6089  inner-membrane translocator  35.47 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.761591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  32.37 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>