More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1849 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1849  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  672    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.210601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  37.61 
 
 
344 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0969  putative lipoprotein  37.5 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.288033  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.56 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  34.48 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  34.78 
 
 
334 aa  198  9e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  35.82 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  37.79 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  35.49 
 
 
328 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  38.21 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.65 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.12 
 
 
328 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.01 
 
 
339 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.15 
 
 
329 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  36.58 
 
 
333 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.89 
 
 
326 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  35.58 
 
 
329 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  37.12 
 
 
332 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  40.91 
 
 
333 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5161  extra-cytoplasmic solute receptor  34.26 
 
 
341 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547548 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36 
 
 
336 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.66 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  36.12 
 
 
334 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4638  hypothetical protein  35.28 
 
 
326 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.66 
 
 
328 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  34.88 
 
 
329 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  36.69 
 
 
331 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  36.33 
 
 
338 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  37.79 
 
 
324 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  33.33 
 
 
332 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  36.77 
 
 
312 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  36.16 
 
 
330 aa  188  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.28 
 
 
337 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  36.24 
 
 
330 aa  188  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0157  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 
336 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0128132  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  35.79 
 
 
330 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  37.12 
 
 
332 aa  187  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  35.25 
 
 
342 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  35.8 
 
 
331 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0983  hypothetical protein  37.83 
 
 
339 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  35.88 
 
 
325 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  33.43 
 
 
330 aa  186  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  185  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  35.1 
 
 
326 aa  185  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  35.35 
 
 
356 aa  185  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1717  hypothetical protein  33.03 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  33.64 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5551  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.23 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.11 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4980  hypothetical protein  34.33 
 
 
321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.790818  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  36.66 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  35.57 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  34.64 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  34.67 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  32.64 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  34.85 
 
 
326 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  37.87 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  35.24 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.87 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  34.83 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  37.06 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  34.97 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  33.86 
 
 
320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  36.27 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  33.03 
 
 
336 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  34.25 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.31 
 
 
322 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  32.07 
 
 
339 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  35.45 
 
 
338 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  34.29 
 
 
323 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5108  hypothetical protein  31.92 
 
 
324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1797  hypothetical protein  37.99 
 
 
334 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0211033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  34.58 
 
 
341 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  34.67 
 
 
330 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.28 
 
 
331 aa  181  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  32.67 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.28 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  34.78 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0255  hypothetical protein  38.54 
 
 
332 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4289  hypothetical protein  33.67 
 
 
322 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0170791  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  36.42 
 
 
325 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  33.64 
 
 
324 aa  180  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  31.68 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  34.76 
 
 
698 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.46 
 
 
334 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  33.45 
 
 
322 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  36.39 
 
 
334 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2537  hypothetical protein  33.23 
 
 
329 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  32.91 
 
 
326 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0709  hypothetical protein  34.92 
 
 
325 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  32.82 
 
 
327 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0744  hypothetical protein  35 
 
 
325 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3920  extra-cytoplasmic solute receptor  33.84 
 
 
325 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00653883  normal  0.672719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.33 
 
 
334 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  32.02 
 
 
331 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  35.62 
 
 
332 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3907  hypothetical protein  35.86 
 
 
335 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5677  hypothetical protein  32.79 
 
 
323 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.898188  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  33.87 
 
 
345 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>